Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY97

Ssu72, RNA polymerase II subunit A C-terminal domain phosphatase SSU72, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssu72Q9CY97 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ssu72Q9CY97 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ssu72Q9CY97 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ssu72Q9CY97 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ssu72Q9CY97 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ssu72Q9CY97 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ssu72Q9CY97 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Ssu72Q9CY97 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ssu72Q9CY97 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ssu72Q9CY97 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ssu72Q9CY97 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ssu72Q9CY97 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ssu72Q9CY97 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ssu72Q9CY97 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ssu72Q9CY97 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ssu72Q9CY97 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ssu72Q9CY97 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ssu72Q9CY97 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Ssu72Q9CY97 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ssu72Q9CY97 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ssu72Q9CY97 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ssu72Q9CY97 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ssu72Q9CY97 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ssu72Q9CY97 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ssu72Q9CY97 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ssu72Q9CY97 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ssu72Q9CY97 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ssu72Q9CY97 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ssu72Q9CY97 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ssu72Q9CY97 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ssu72Q9CY97 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ssu72Q9CY97 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ssu72Q9CY97 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ssu72Q9CY97 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ssu72Q9CY97 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ssu72Q9CY97 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ssu72Q9CY97 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ssu72Q9CY97 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ssu72Q9CY97 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ssu72Q9CY97 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ssu72Q9CY97 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ssu72Q9CY97 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ssu72Q9CY97 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ssu72Q9CY97 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ssu72Q9CY97 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ssu72Q9CY97 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ssu72Q9CY97 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ssu72Q9CY97 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ssu72Q9CY97 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ssu72Q9CY97 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ssu72Q9CY97 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ssu72Q9CY97 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ssu72Q9CY97 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ssu72Q9CY97 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ssu72Q9CY97 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ssu72Q9CY97 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ssu72Q9CY97 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ssu72Q9CY97 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ssu72Q9CY97 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ssu72Q9CY97 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ssu72Q9CY97 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ssu72Q9CY97 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ssu72Q9CY97 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ssu72Q9CY97 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ssu72Q9CY97 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ssu72Q9CY97 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ssu72Q9CY97 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ssu72Q9CY97 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ssu72Q9CY97 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ssu72Q9CY97 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ssu72Q9CY97 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ssu72Q9CY97 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ssu72Q9CY97 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ssu72Q9CY97 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ssu72Q9CY97 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ssu72Q9CY97 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ssu72Q9CY97 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ssu72Q9CY97 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ssu72Q9CY97 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ssu72Q9CY97 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ssu72Q9CY97 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ssu72Q9CY97 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ssu72Q9CY97 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ssu72Q9CY97 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ssu72Q9CY97 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ssu72Q9CY97 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ssu72Q9CY97 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ssu72Q9CY97 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ssu72Q9CY97 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ssu72Q9CY97 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Ssu72Q9CY97 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ssu72Q9CY97 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ssu72Q9CY97 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ssu72Q9CY97 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ssu72Q9CY97 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ssu72Q9CY97 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ssu72Q9CY97 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ssu72Q9CY97 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ssu72Q9CY97 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ssu72Q9CY97 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.4 ms