Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQL2

Ccer1, Coiled-coil domain-containing glutamate-rich protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccer1Q9CQL2 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccer1Q9CQL2 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccer1Q9CQL2 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccer1Q9CQL2 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccer1Q9CQL2 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccer1Q9CQL2 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccer1Q9CQL2 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccer1Q9CQL2 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccer1Q9CQL2 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccer1Q9CQL2 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccer1Q9CQL2 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccer1Q9CQL2 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccer1Q9CQL2 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccer1Q9CQL2 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccer1Q9CQL2 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccer1Q9CQL2 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccer1Q9CQL2 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccer1Q9CQL2 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccer1Q9CQL2 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccer1Q9CQL2 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccer1Q9CQL2 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccer1Q9CQL2 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccer1Q9CQL2 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccer1Q9CQL2 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccer1Q9CQL2 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccer1Q9CQL2 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccer1Q9CQL2 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccer1Q9CQL2 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccer1Q9CQL2 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccer1Q9CQL2 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccer1Q9CQL2 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccer1Q9CQL2 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccer1Q9CQL2 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ccer1Q9CQL2 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ccer1Q9CQL2 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ccer1Q9CQL2 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ccer1Q9CQL2 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ccer1Q9CQL2 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ccer1Q9CQL2 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ccer1Q9CQL2 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccer1Q9CQL2 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccer1Q9CQL2 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccer1Q9CQL2 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccer1Q9CQL2 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccer1Q9CQL2 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccer1Q9CQL2 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccer1Q9CQL2 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccer1Q9CQL2 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccer1Q9CQL2 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccer1Q9CQL2 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccer1Q9CQL2 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccer1Q9CQL2 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccer1Q9CQL2 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccer1Q9CQL2 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccer1Q9CQL2 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccer1Q9CQL2 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccer1Q9CQL2 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccer1Q9CQL2 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccer1Q9CQL2 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccer1Q9CQL2 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccer1Q9CQL2 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccer1Q9CQL2 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccer1Q9CQL2 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccer1Q9CQL2 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccer1Q9CQL2 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccer1Q9CQL2 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccer1Q9CQL2 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccer1Q9CQL2 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccer1Q9CQL2 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccer1Q9CQL2 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccer1Q9CQL2 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccer1Q9CQL2 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccer1Q9CQL2 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccer1Q9CQL2 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccer1Q9CQL2 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccer1Q9CQL2 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccer1Q9CQL2 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ccer1Q9CQL2 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ccer1Q9CQL2 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ccer1Q9CQL2 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ccer1Q9CQL2 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ccer1Q9CQL2 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ccer1Q9CQL2 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Ccer1Q9CQL2 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Ccer1Q9CQL2 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccer1Q9CQL2 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccer1Q9CQL2 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccer1Q9CQL2 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccer1Q9CQL2 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccer1Q9CQL2 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccer1Q9CQL2 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccer1Q9CQL2 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccer1Q9CQL2 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccer1Q9CQL2 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccer1Q9CQL2 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccer1Q9CQL2 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccer1Q9CQL2 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccer1Q9CQL2 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccer1Q9CQL2 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccer1Q9CQL2 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms