Protein–RNA interactions for Protein: Q99JW5

Epcam, Epithelial cell adhesion molecule, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EpcamQ99JW5 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
EpcamQ99JW5 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
EpcamQ99JW5 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
EpcamQ99JW5 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.18
EpcamQ99JW5 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
EpcamQ99JW5 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
EpcamQ99JW5 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
EpcamQ99JW5 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EpcamQ99JW5 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EpcamQ99JW5 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EpcamQ99JW5 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EpcamQ99JW5 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EpcamQ99JW5 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
EpcamQ99JW5 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
EpcamQ99JW5 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EpcamQ99JW5 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EpcamQ99JW5 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EpcamQ99JW5 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
EpcamQ99JW5 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EpcamQ99JW5 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EpcamQ99JW5 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EpcamQ99JW5 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EpcamQ99JW5 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EpcamQ99JW5 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EpcamQ99JW5 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EpcamQ99JW5 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EpcamQ99JW5 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EpcamQ99JW5 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EpcamQ99JW5 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EpcamQ99JW5 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EpcamQ99JW5 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
EpcamQ99JW5 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
EpcamQ99JW5 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
EpcamQ99JW5 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EpcamQ99JW5 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EpcamQ99JW5 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EpcamQ99JW5 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
EpcamQ99JW5 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
EpcamQ99JW5 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
EpcamQ99JW5 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
EpcamQ99JW5 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
EpcamQ99JW5 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
EpcamQ99JW5 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
EpcamQ99JW5 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
EpcamQ99JW5 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
EpcamQ99JW5 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
EpcamQ99JW5 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
EpcamQ99JW5 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
EpcamQ99JW5 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
EpcamQ99JW5 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
EpcamQ99JW5 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
EpcamQ99JW5 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
EpcamQ99JW5 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
EpcamQ99JW5 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
EpcamQ99JW5 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
EpcamQ99JW5 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
EpcamQ99JW5 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
EpcamQ99JW5 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
EpcamQ99JW5 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
EpcamQ99JW5 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
EpcamQ99JW5 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
EpcamQ99JW5 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
EpcamQ99JW5 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EpcamQ99JW5 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EpcamQ99JW5 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
EpcamQ99JW5 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EpcamQ99JW5 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EpcamQ99JW5 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EpcamQ99JW5 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
EpcamQ99JW5 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
EpcamQ99JW5 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
EpcamQ99JW5 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EpcamQ99JW5 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EpcamQ99JW5 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
EpcamQ99JW5 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
EpcamQ99JW5 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
EpcamQ99JW5 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EpcamQ99JW5 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EpcamQ99JW5 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EpcamQ99JW5 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EpcamQ99JW5 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EpcamQ99JW5 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EpcamQ99JW5 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EpcamQ99JW5 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
EpcamQ99JW5 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EpcamQ99JW5 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EpcamQ99JW5 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EpcamQ99JW5 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EpcamQ99JW5 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EpcamQ99JW5 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EpcamQ99JW5 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EpcamQ99JW5 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EpcamQ99JW5 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EpcamQ99JW5 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EpcamQ99JW5 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EpcamQ99JW5 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EpcamQ99JW5 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EpcamQ99JW5 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EpcamQ99JW5 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EpcamQ99JW5 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms