Protein–RNA interactions for Protein: Q922Y1

Ubxn1, UBX domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn1Q922Y1 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ubxn1Q922Y1 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ubxn1Q922Y1 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ubxn1Q922Y1 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Ubxn1Q922Y1 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ubxn1Q922Y1 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ubxn1Q922Y1 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ubxn1Q922Y1 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ubxn1Q922Y1 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ubxn1Q922Y1 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ubxn1Q922Y1 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ubxn1Q922Y1 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ubxn1Q922Y1 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ubxn1Q922Y1 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ubxn1Q922Y1 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ubxn1Q922Y1 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ubxn1Q922Y1 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ubxn1Q922Y1 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ubxn1Q922Y1 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ubxn1Q922Y1 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ubxn1Q922Y1 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ubxn1Q922Y1 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ubxn1Q922Y1 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ubxn1Q922Y1 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ubxn1Q922Y1 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ubxn1Q922Y1 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ubxn1Q922Y1 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ubxn1Q922Y1 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ubxn1Q922Y1 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ubxn1Q922Y1 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ubxn1Q922Y1 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ubxn1Q922Y1 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Ubxn1Q922Y1 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Ubxn1Q922Y1 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ubxn1Q922Y1 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ubxn1Q922Y1 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ubxn1Q922Y1 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ubxn1Q922Y1 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ubxn1Q922Y1 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ubxn1Q922Y1 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ubxn1Q922Y1 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ubxn1Q922Y1 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ubxn1Q922Y1 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ubxn1Q922Y1 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ubxn1Q922Y1 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ubxn1Q922Y1 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ubxn1Q922Y1 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ubxn1Q922Y1 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ubxn1Q922Y1 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ubxn1Q922Y1 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ubxn1Q922Y1 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ubxn1Q922Y1 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ubxn1Q922Y1 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ubxn1Q922Y1 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ubxn1Q922Y1 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ubxn1Q922Y1 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ubxn1Q922Y1 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ubxn1Q922Y1 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ubxn1Q922Y1 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ubxn1Q922Y1 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ubxn1Q922Y1 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ubxn1Q922Y1 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ubxn1Q922Y1 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ubxn1Q922Y1 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ubxn1Q922Y1 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ubxn1Q922Y1 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ubxn1Q922Y1 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ubxn1Q922Y1 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ubxn1Q922Y1 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ubxn1Q922Y1 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ubxn1Q922Y1 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ubxn1Q922Y1 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ubxn1Q922Y1 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ubxn1Q922Y1 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Ubxn1Q922Y1 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ubxn1Q922Y1 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ubxn1Q922Y1 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ubxn1Q922Y1 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ubxn1Q922Y1 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ubxn1Q922Y1 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ubxn1Q922Y1 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ubxn1Q922Y1 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ubxn1Q922Y1 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ubxn1Q922Y1 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ubxn1Q922Y1 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ubxn1Q922Y1 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ubxn1Q922Y1 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ubxn1Q922Y1 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ubxn1Q922Y1 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ubxn1Q922Y1 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ubxn1Q922Y1 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ubxn1Q922Y1 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ubxn1Q922Y1 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ubxn1Q922Y1 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ubxn1Q922Y1 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ubxn1Q922Y1 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ubxn1Q922Y1 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ubxn1Q922Y1 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ubxn1Q922Y1 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ubxn1Q922Y1 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms