Protein–RNA interactions for Protein: Q91YR7

Prpf6, Pre-mRNA-processing factor 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 941 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf6Q91YR7 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Prpf6Q91YR7 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Prpf6Q91YR7 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Prpf6Q91YR7 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Prpf6Q91YR7 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Prpf6Q91YR7 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Prpf6Q91YR7 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Prpf6Q91YR7 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Prpf6Q91YR7 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Prpf6Q91YR7 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Prpf6Q91YR7 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Prpf6Q91YR7 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Prpf6Q91YR7 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Prpf6Q91YR7 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Prpf6Q91YR7 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Prpf6Q91YR7 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Prpf6Q91YR7 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Prpf6Q91YR7 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Prpf6Q91YR7 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Prpf6Q91YR7 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Prpf6Q91YR7 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Prpf6Q91YR7 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Prpf6Q91YR7 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Prpf6Q91YR7 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Prpf6Q91YR7 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Prpf6Q91YR7 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Prpf6Q91YR7 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Prpf6Q91YR7 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Prpf6Q91YR7 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Prpf6Q91YR7 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Prpf6Q91YR7 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Prpf6Q91YR7 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Prpf6Q91YR7 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Prpf6Q91YR7 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Prpf6Q91YR7 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Prpf6Q91YR7 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Prpf6Q91YR7 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Prpf6Q91YR7 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Prpf6Q91YR7 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Prpf6Q91YR7 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Prpf6Q91YR7 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Prpf6Q91YR7 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Prpf6Q91YR7 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Prpf6Q91YR7 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Prpf6Q91YR7 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Prpf6Q91YR7 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Prpf6Q91YR7 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Prpf6Q91YR7 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Prpf6Q91YR7 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Prpf6Q91YR7 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Prpf6Q91YR7 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Prpf6Q91YR7 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Prpf6Q91YR7 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Prpf6Q91YR7 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Prpf6Q91YR7 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Prpf6Q91YR7 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Prpf6Q91YR7 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Prpf6Q91YR7 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Prpf6Q91YR7 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Prpf6Q91YR7 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Prpf6Q91YR7 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Prpf6Q91YR7 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Prpf6Q91YR7 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Prpf6Q91YR7 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Prpf6Q91YR7 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Prpf6Q91YR7 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Prpf6Q91YR7 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Prpf6Q91YR7 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Prpf6Q91YR7 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Prpf6Q91YR7 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Prpf6Q91YR7 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Prpf6Q91YR7 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Prpf6Q91YR7 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Prpf6Q91YR7 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Prpf6Q91YR7 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Prpf6Q91YR7 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Prpf6Q91YR7 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Prpf6Q91YR7 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Prpf6Q91YR7 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Prpf6Q91YR7 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Prpf6Q91YR7 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Prpf6Q91YR7 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Prpf6Q91YR7 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Prpf6Q91YR7 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Prpf6Q91YR7 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Prpf6Q91YR7 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Prpf6Q91YR7 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Prpf6Q91YR7 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Prpf6Q91YR7 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Prpf6Q91YR7 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Prpf6Q91YR7 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Prpf6Q91YR7 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Prpf6Q91YR7 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Prpf6Q91YR7 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Prpf6Q91YR7 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Prpf6Q91YR7 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Prpf6Q91YR7 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Prpf6Q91YR7 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Prpf6Q91YR7 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Prpf6Q91YR7 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms