Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHC3

Selenom, Selenoprotein M, mousemouse

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SelenomQ8VHC3 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SelenomQ8VHC3 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SelenomQ8VHC3 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SelenomQ8VHC3 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SelenomQ8VHC3 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SelenomQ8VHC3 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SelenomQ8VHC3 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SelenomQ8VHC3 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SelenomQ8VHC3 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SelenomQ8VHC3 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SelenomQ8VHC3 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SelenomQ8VHC3 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
SelenomQ8VHC3 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SelenomQ8VHC3 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SelenomQ8VHC3 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SelenomQ8VHC3 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SelenomQ8VHC3 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SelenomQ8VHC3 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SelenomQ8VHC3 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SelenomQ8VHC3 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SelenomQ8VHC3 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SelenomQ8VHC3 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SelenomQ8VHC3 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SelenomQ8VHC3 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SelenomQ8VHC3 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SelenomQ8VHC3 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SelenomQ8VHC3 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SelenomQ8VHC3 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SelenomQ8VHC3 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SelenomQ8VHC3 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SelenomQ8VHC3 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SelenomQ8VHC3 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SelenomQ8VHC3 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SelenomQ8VHC3 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SelenomQ8VHC3 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SelenomQ8VHC3 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SelenomQ8VHC3 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SelenomQ8VHC3 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SelenomQ8VHC3 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SelenomQ8VHC3 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SelenomQ8VHC3 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SelenomQ8VHC3 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SelenomQ8VHC3 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SelenomQ8VHC3 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SelenomQ8VHC3 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SelenomQ8VHC3 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
SelenomQ8VHC3 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
SelenomQ8VHC3 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
SelenomQ8VHC3 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
SelenomQ8VHC3 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SelenomQ8VHC3 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SelenomQ8VHC3 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SelenomQ8VHC3 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SelenomQ8VHC3 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SelenomQ8VHC3 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SelenomQ8VHC3 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SelenomQ8VHC3 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SelenomQ8VHC3 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SelenomQ8VHC3 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SelenomQ8VHC3 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SelenomQ8VHC3 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SelenomQ8VHC3 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SelenomQ8VHC3 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SelenomQ8VHC3 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SelenomQ8VHC3 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SelenomQ8VHC3 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SelenomQ8VHC3 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SelenomQ8VHC3 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SelenomQ8VHC3 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SelenomQ8VHC3 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SelenomQ8VHC3 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SelenomQ8VHC3 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SelenomQ8VHC3 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SelenomQ8VHC3 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SelenomQ8VHC3 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SelenomQ8VHC3 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SelenomQ8VHC3 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
SelenomQ8VHC3 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
SelenomQ8VHC3 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SelenomQ8VHC3 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SelenomQ8VHC3 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SelenomQ8VHC3 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SelenomQ8VHC3 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SelenomQ8VHC3 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SelenomQ8VHC3 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SelenomQ8VHC3 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SelenomQ8VHC3 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SelenomQ8VHC3 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SelenomQ8VHC3 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SelenomQ8VHC3 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SelenomQ8VHC3 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SelenomQ8VHC3 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SelenomQ8VHC3 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SelenomQ8VHC3 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SelenomQ8VHC3 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SelenomQ8VHC3 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SelenomQ8VHC3 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SelenomQ8VHC3 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SelenomQ8VHC3 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SelenomQ8VHC3 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.7 ms