Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE99

Ccdc115, Coiled-coil domain-containing protein 115, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc115Q8VE99 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc115Q8VE99 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc115Q8VE99 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc115Q8VE99 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc115Q8VE99 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc115Q8VE99 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc115Q8VE99 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc115Q8VE99 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc115Q8VE99 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc115Q8VE99 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc115Q8VE99 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc115Q8VE99 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc115Q8VE99 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc115Q8VE99 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc115Q8VE99 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc115Q8VE99 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc115Q8VE99 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc115Q8VE99 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc115Q8VE99 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc115Q8VE99 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc115Q8VE99 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc115Q8VE99 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc115Q8VE99 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc115Q8VE99 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc115Q8VE99 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc115Q8VE99 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc115Q8VE99 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc115Q8VE99 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc115Q8VE99 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc115Q8VE99 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc115Q8VE99 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc115Q8VE99 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc115Q8VE99 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc115Q8VE99 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc115Q8VE99 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc115Q8VE99 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc115Q8VE99 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc115Q8VE99 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc115Q8VE99 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc115Q8VE99 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Ccdc115Q8VE99 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Ccdc115Q8VE99 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Ccdc115Q8VE99 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc115Q8VE99 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc115Q8VE99 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc115Q8VE99 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc115Q8VE99 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc115Q8VE99 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc115Q8VE99 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc115Q8VE99 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc115Q8VE99 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc115Q8VE99 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc115Q8VE99 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc115Q8VE99 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc115Q8VE99 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc115Q8VE99 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc115Q8VE99 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc115Q8VE99 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc115Q8VE99 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc115Q8VE99 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc115Q8VE99 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc115Q8VE99 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc115Q8VE99 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc115Q8VE99 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc115Q8VE99 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc115Q8VE99 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc115Q8VE99 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc115Q8VE99 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc115Q8VE99 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc115Q8VE99 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc115Q8VE99 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc115Q8VE99 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc115Q8VE99 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc115Q8VE99 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc115Q8VE99 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc115Q8VE99 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc115Q8VE99 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc115Q8VE99 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc115Q8VE99 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc115Q8VE99 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc115Q8VE99 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc115Q8VE99 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc115Q8VE99 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc115Q8VE99 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc115Q8VE99 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc115Q8VE99 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc115Q8VE99 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc115Q8VE99 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc115Q8VE99 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc115Q8VE99 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc115Q8VE99 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc115Q8VE99 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc115Q8VE99 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc115Q8VE99 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc115Q8VE99 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc115Q8VE99 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc115Q8VE99 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc115Q8VE99 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc115Q8VE99 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc115Q8VE99 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.8 ms