Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDU5

Snrk, SNF-related serine/threonine-protein kinase, mousemouse

Predictions only

Length 748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnrkQ8VDU5 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SnrkQ8VDU5 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SnrkQ8VDU5 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
SnrkQ8VDU5 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
SnrkQ8VDU5 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
SnrkQ8VDU5 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
SnrkQ8VDU5 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SnrkQ8VDU5 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SnrkQ8VDU5 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SnrkQ8VDU5 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SnrkQ8VDU5 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
SnrkQ8VDU5 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SnrkQ8VDU5 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SnrkQ8VDU5 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SnrkQ8VDU5 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
SnrkQ8VDU5 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SnrkQ8VDU5 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SnrkQ8VDU5 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SnrkQ8VDU5 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SnrkQ8VDU5 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SnrkQ8VDU5 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SnrkQ8VDU5 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SnrkQ8VDU5 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
SnrkQ8VDU5 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SnrkQ8VDU5 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SnrkQ8VDU5 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SnrkQ8VDU5 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SnrkQ8VDU5 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SnrkQ8VDU5 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SnrkQ8VDU5 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SnrkQ8VDU5 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SnrkQ8VDU5 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SnrkQ8VDU5 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SnrkQ8VDU5 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SnrkQ8VDU5 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SnrkQ8VDU5 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SnrkQ8VDU5 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SnrkQ8VDU5 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SnrkQ8VDU5 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SnrkQ8VDU5 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SnrkQ8VDU5 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SnrkQ8VDU5 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SnrkQ8VDU5 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
SnrkQ8VDU5 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SnrkQ8VDU5 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SnrkQ8VDU5 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SnrkQ8VDU5 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SnrkQ8VDU5 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SnrkQ8VDU5 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
SnrkQ8VDU5 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
SnrkQ8VDU5 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SnrkQ8VDU5 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SnrkQ8VDU5 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
SnrkQ8VDU5 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SnrkQ8VDU5 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SnrkQ8VDU5 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SnrkQ8VDU5 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SnrkQ8VDU5 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SnrkQ8VDU5 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
SnrkQ8VDU5 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SnrkQ8VDU5 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SnrkQ8VDU5 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SnrkQ8VDU5 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SnrkQ8VDU5 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SnrkQ8VDU5 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SnrkQ8VDU5 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SnrkQ8VDU5 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SnrkQ8VDU5 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SnrkQ8VDU5 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SnrkQ8VDU5 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SnrkQ8VDU5 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SnrkQ8VDU5 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SnrkQ8VDU5 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SnrkQ8VDU5 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SnrkQ8VDU5 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SnrkQ8VDU5 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SnrkQ8VDU5 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SnrkQ8VDU5 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SnrkQ8VDU5 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SnrkQ8VDU5 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SnrkQ8VDU5 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SnrkQ8VDU5 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SnrkQ8VDU5 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
SnrkQ8VDU5 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SnrkQ8VDU5 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SnrkQ8VDU5 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
SnrkQ8VDU5 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
SnrkQ8VDU5 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SnrkQ8VDU5 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SnrkQ8VDU5 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SnrkQ8VDU5 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SnrkQ8VDU5 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SnrkQ8VDU5 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SnrkQ8VDU5 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
SnrkQ8VDU5 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SnrkQ8VDU5 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SnrkQ8VDU5 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SnrkQ8VDU5 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SnrkQ8VDU5 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SnrkQ8VDU5 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms