Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCE1

Dnajc28, DnaJ homolog subfamily C member 28, mousemouse

Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnajc28Q8VCE1 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Dnajc28Q8VCE1 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Dnajc28Q8VCE1 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Dnajc28Q8VCE1 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Dnajc28Q8VCE1 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Dnajc28Q8VCE1 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Dnajc28Q8VCE1 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Dnajc28Q8VCE1 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Dnajc28Q8VCE1 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Dnajc28Q8VCE1 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Dnajc28Q8VCE1 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Dnajc28Q8VCE1 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Dnajc28Q8VCE1 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Dnajc28Q8VCE1 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Dnajc28Q8VCE1 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Dnajc28Q8VCE1 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Dnajc28Q8VCE1 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Dnajc28Q8VCE1 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Dnajc28Q8VCE1 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Dnajc28Q8VCE1 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Dnajc28Q8VCE1 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Dnajc28Q8VCE1 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Dnajc28Q8VCE1 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Dnajc28Q8VCE1 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Dnajc28Q8VCE1 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Dnajc28Q8VCE1 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Dnajc28Q8VCE1 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Dnajc28Q8VCE1 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Dnajc28Q8VCE1 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Dnajc28Q8VCE1 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Dnajc28Q8VCE1 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Dnajc28Q8VCE1 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Dnajc28Q8VCE1 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Dnajc28Q8VCE1 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Dnajc28Q8VCE1 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Dnajc28Q8VCE1 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Dnajc28Q8VCE1 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Dnajc28Q8VCE1 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Dnajc28Q8VCE1 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Dnajc28Q8VCE1 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Dnajc28Q8VCE1 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Dnajc28Q8VCE1 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Dnajc28Q8VCE1 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Dnajc28Q8VCE1 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Dnajc28Q8VCE1 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Dnajc28Q8VCE1 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Dnajc28Q8VCE1 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Dnajc28Q8VCE1 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Dnajc28Q8VCE1 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Dnajc28Q8VCE1 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Dnajc28Q8VCE1 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Dnajc28Q8VCE1 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Dnajc28Q8VCE1 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Dnajc28Q8VCE1 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Dnajc28Q8VCE1 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Dnajc28Q8VCE1 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Dnajc28Q8VCE1 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Dnajc28Q8VCE1 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Dnajc28Q8VCE1 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Dnajc28Q8VCE1 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Dnajc28Q8VCE1 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Dnajc28Q8VCE1 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Dnajc28Q8VCE1 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Dnajc28Q8VCE1 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Dnajc28Q8VCE1 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Dnajc28Q8VCE1 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Dnajc28Q8VCE1 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Dnajc28Q8VCE1 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Dnajc28Q8VCE1 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Dnajc28Q8VCE1 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Dnajc28Q8VCE1 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
Dnajc28Q8VCE1 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Dnajc28Q8VCE1 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Dnajc28Q8VCE1 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Dnajc28Q8VCE1 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Dnajc28Q8VCE1 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Dnajc28Q8VCE1 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Dnajc28Q8VCE1 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Dnajc28Q8VCE1 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Dnajc28Q8VCE1 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Dnajc28Q8VCE1 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Dnajc28Q8VCE1 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Dnajc28Q8VCE1 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Dnajc28Q8VCE1 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Dnajc28Q8VCE1 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Dnajc28Q8VCE1 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Dnajc28Q8VCE1 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Dnajc28Q8VCE1 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Dnajc28Q8VCE1 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Dnajc28Q8VCE1 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Dnajc28Q8VCE1 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Dnajc28Q8VCE1 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Dnajc28Q8VCE1 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Dnajc28Q8VCE1 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Dnajc28Q8VCE1 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Dnajc28Q8VCE1 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Dnajc28Q8VCE1 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Dnajc28Q8VCE1 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Dnajc28Q8VCE1 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Dnajc28Q8VCE1 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.5 ms