Protein–RNA interactions for Protein: Q8K377

Lrrtm1, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrtm1Q8K377 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lrrtm1Q8K377 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lrrtm1Q8K377 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lrrtm1Q8K377 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lrrtm1Q8K377 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Lrrtm1Q8K377 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lrrtm1Q8K377 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lrrtm1Q8K377 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lrrtm1Q8K377 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lrrtm1Q8K377 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lrrtm1Q8K377 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lrrtm1Q8K377 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lrrtm1Q8K377 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lrrtm1Q8K377 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lrrtm1Q8K377 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lrrtm1Q8K377 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lrrtm1Q8K377 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lrrtm1Q8K377 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lrrtm1Q8K377 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lrrtm1Q8K377 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lrrtm1Q8K377 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lrrtm1Q8K377 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Lrrtm1Q8K377 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Lrrtm1Q8K377 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Lrrtm1Q8K377 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Lrrtm1Q8K377 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Lrrtm1Q8K377 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Lrrtm1Q8K377 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Lrrtm1Q8K377 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Lrrtm1Q8K377 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Lrrtm1Q8K377 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Lrrtm1Q8K377 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Lrrtm1Q8K377 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Lrrtm1Q8K377 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Lrrtm1Q8K377 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Lrrtm1Q8K377 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Lrrtm1Q8K377 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Lrrtm1Q8K377 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Lrrtm1Q8K377 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Lrrtm1Q8K377 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Lrrtm1Q8K377 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Lrrtm1Q8K377 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Lrrtm1Q8K377 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lrrtm1Q8K377 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lrrtm1Q8K377 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lrrtm1Q8K377 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lrrtm1Q8K377 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lrrtm1Q8K377 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lrrtm1Q8K377 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lrrtm1Q8K377 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lrrtm1Q8K377 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lrrtm1Q8K377 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lrrtm1Q8K377 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lrrtm1Q8K377 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lrrtm1Q8K377 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lrrtm1Q8K377 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Lrrtm1Q8K377 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Lrrtm1Q8K377 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Lrrtm1Q8K377 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Lrrtm1Q8K377 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Lrrtm1Q8K377 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Lrrtm1Q8K377 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Lrrtm1Q8K377 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Lrrtm1Q8K377 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Lrrtm1Q8K377 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Lrrtm1Q8K377 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Lrrtm1Q8K377 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Lrrtm1Q8K377 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Lrrtm1Q8K377 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Lrrtm1Q8K377 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Lrrtm1Q8K377 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Lrrtm1Q8K377 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Lrrtm1Q8K377 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Lrrtm1Q8K377 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lrrtm1Q8K377 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lrrtm1Q8K377 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lrrtm1Q8K377 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lrrtm1Q8K377 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Lrrtm1Q8K377 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Lrrtm1Q8K377 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lrrtm1Q8K377 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lrrtm1Q8K377 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lrrtm1Q8K377 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lrrtm1Q8K377 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lrrtm1Q8K377 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lrrtm1Q8K377 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lrrtm1Q8K377 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lrrtm1Q8K377 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lrrtm1Q8K377 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lrrtm1Q8K377 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lrrtm1Q8K377 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lrrtm1Q8K377 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lrrtm1Q8K377 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lrrtm1Q8K377 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lrrtm1Q8K377 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lrrtm1Q8K377 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lrrtm1Q8K377 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lrrtm1Q8K377 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Lrrtm1Q8K377 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lrrtm1Q8K377 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms