Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2F3

Depp1, Protein DEPP1, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Depp1Q8K2F3 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Depp1Q8K2F3 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Depp1Q8K2F3 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Depp1Q8K2F3 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Depp1Q8K2F3 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Depp1Q8K2F3 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Depp1Q8K2F3 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Depp1Q8K2F3 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Depp1Q8K2F3 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Depp1Q8K2F3 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Depp1Q8K2F3 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Depp1Q8K2F3 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Depp1Q8K2F3 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Depp1Q8K2F3 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Depp1Q8K2F3 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Depp1Q8K2F3 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Depp1Q8K2F3 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Depp1Q8K2F3 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Depp1Q8K2F3 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Depp1Q8K2F3 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Depp1Q8K2F3 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Depp1Q8K2F3 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Depp1Q8K2F3 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Depp1Q8K2F3 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Depp1Q8K2F3 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Depp1Q8K2F3 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Depp1Q8K2F3 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Depp1Q8K2F3 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Depp1Q8K2F3 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Depp1Q8K2F3 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Depp1Q8K2F3 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Depp1Q8K2F3 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Depp1Q8K2F3 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Depp1Q8K2F3 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Depp1Q8K2F3 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Depp1Q8K2F3 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Depp1Q8K2F3 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Depp1Q8K2F3 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Depp1Q8K2F3 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Depp1Q8K2F3 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Depp1Q8K2F3 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Depp1Q8K2F3 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Depp1Q8K2F3 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Depp1Q8K2F3 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Depp1Q8K2F3 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Depp1Q8K2F3 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Depp1Q8K2F3 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Depp1Q8K2F3 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Depp1Q8K2F3 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Depp1Q8K2F3 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Depp1Q8K2F3 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Depp1Q8K2F3 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Depp1Q8K2F3 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Depp1Q8K2F3 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Depp1Q8K2F3 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Depp1Q8K2F3 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Depp1Q8K2F3 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Depp1Q8K2F3 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Depp1Q8K2F3 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Depp1Q8K2F3 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Depp1Q8K2F3 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Depp1Q8K2F3 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Depp1Q8K2F3 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Depp1Q8K2F3 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Depp1Q8K2F3 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Depp1Q8K2F3 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Depp1Q8K2F3 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Depp1Q8K2F3 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Depp1Q8K2F3 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Depp1Q8K2F3 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Depp1Q8K2F3 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Depp1Q8K2F3 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Depp1Q8K2F3 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Depp1Q8K2F3 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Depp1Q8K2F3 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Depp1Q8K2F3 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Depp1Q8K2F3 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Depp1Q8K2F3 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Depp1Q8K2F3 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Depp1Q8K2F3 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Depp1Q8K2F3 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Depp1Q8K2F3 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Depp1Q8K2F3 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Depp1Q8K2F3 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Depp1Q8K2F3 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Depp1Q8K2F3 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Depp1Q8K2F3 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Depp1Q8K2F3 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Depp1Q8K2F3 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Depp1Q8K2F3 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Depp1Q8K2F3 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Depp1Q8K2F3 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Depp1Q8K2F3 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Depp1Q8K2F3 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Depp1Q8K2F3 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Depp1Q8K2F3 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Depp1Q8K2F3 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Depp1Q8K2F3 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Depp1Q8K2F3 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Depp1Q8K2F3 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms