Protein–RNA interactions for Protein: Q8K0D5

Gfm1, Elongation factor G, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 751 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfm1Q8K0D5 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gfm1Q8K0D5 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gfm1Q8K0D5 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gfm1Q8K0D5 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gfm1Q8K0D5 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gfm1Q8K0D5 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gfm1Q8K0D5 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gfm1Q8K0D5 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gfm1Q8K0D5 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gfm1Q8K0D5 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gfm1Q8K0D5 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gfm1Q8K0D5 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Gfm1Q8K0D5 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Gfm1Q8K0D5 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Gfm1Q8K0D5 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Gfm1Q8K0D5 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Gfm1Q8K0D5 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Gfm1Q8K0D5 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Gfm1Q8K0D5 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Gfm1Q8K0D5 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Gfm1Q8K0D5 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Gfm1Q8K0D5 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gfm1Q8K0D5 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gfm1Q8K0D5 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gfm1Q8K0D5 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gfm1Q8K0D5 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gfm1Q8K0D5 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gfm1Q8K0D5 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gfm1Q8K0D5 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gfm1Q8K0D5 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gfm1Q8K0D5 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gfm1Q8K0D5 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Gfm1Q8K0D5 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gfm1Q8K0D5 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gfm1Q8K0D5 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gfm1Q8K0D5 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gfm1Q8K0D5 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gfm1Q8K0D5 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gfm1Q8K0D5 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gfm1Q8K0D5 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Gfm1Q8K0D5 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gfm1Q8K0D5 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gfm1Q8K0D5 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gfm1Q8K0D5 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gfm1Q8K0D5 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gfm1Q8K0D5 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gfm1Q8K0D5 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gfm1Q8K0D5 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gfm1Q8K0D5 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gfm1Q8K0D5 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gfm1Q8K0D5 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gfm1Q8K0D5 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gfm1Q8K0D5 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gfm1Q8K0D5 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gfm1Q8K0D5 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gfm1Q8K0D5 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gfm1Q8K0D5 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gfm1Q8K0D5 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gfm1Q8K0D5 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gfm1Q8K0D5 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gfm1Q8K0D5 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gfm1Q8K0D5 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gfm1Q8K0D5 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gfm1Q8K0D5 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gfm1Q8K0D5 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gfm1Q8K0D5 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gfm1Q8K0D5 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Gfm1Q8K0D5 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gfm1Q8K0D5 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gfm1Q8K0D5 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gfm1Q8K0D5 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Gfm1Q8K0D5 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gfm1Q8K0D5 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gfm1Q8K0D5 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gfm1Q8K0D5 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gfm1Q8K0D5 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gfm1Q8K0D5 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gfm1Q8K0D5 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gfm1Q8K0D5 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gfm1Q8K0D5 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gfm1Q8K0D5 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gfm1Q8K0D5 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gfm1Q8K0D5 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gfm1Q8K0D5 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gfm1Q8K0D5 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gfm1Q8K0D5 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gfm1Q8K0D5 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gfm1Q8K0D5 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gfm1Q8K0D5 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gfm1Q8K0D5 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gfm1Q8K0D5 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gfm1Q8K0D5 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gfm1Q8K0D5 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gfm1Q8K0D5 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gfm1Q8K0D5 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gfm1Q8K0D5 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gfm1Q8K0D5 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gfm1Q8K0D5 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gfm1Q8K0D5 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gfm1Q8K0D5 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms