Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGV9

Tshz3, Teashirt homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,081 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tshz3Q8CGV9 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Tshz3Q8CGV9 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Tshz3Q8CGV9 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Tshz3Q8CGV9 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Tshz3Q8CGV9 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Tshz3Q8CGV9 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Tshz3Q8CGV9 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Tshz3Q8CGV9 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Tshz3Q8CGV9 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Tshz3Q8CGV9 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Tshz3Q8CGV9 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Tshz3Q8CGV9 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Tshz3Q8CGV9 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Tshz3Q8CGV9 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Tshz3Q8CGV9 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Tshz3Q8CGV9 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Tshz3Q8CGV9 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Tshz3Q8CGV9 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Tshz3Q8CGV9 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Tshz3Q8CGV9 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Tshz3Q8CGV9 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Tshz3Q8CGV9 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Tshz3Q8CGV9 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Tshz3Q8CGV9 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Tshz3Q8CGV9 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Tshz3Q8CGV9 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tshz3Q8CGV9 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tshz3Q8CGV9 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tshz3Q8CGV9 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tshz3Q8CGV9 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tshz3Q8CGV9 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tshz3Q8CGV9 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tshz3Q8CGV9 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tshz3Q8CGV9 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Tshz3Q8CGV9 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Tshz3Q8CGV9 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Tshz3Q8CGV9 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Tshz3Q8CGV9 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Tshz3Q8CGV9 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Tshz3Q8CGV9 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Tshz3Q8CGV9 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Tshz3Q8CGV9 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Tshz3Q8CGV9 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Tshz3Q8CGV9 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Tshz3Q8CGV9 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Tshz3Q8CGV9 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Tshz3Q8CGV9 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Tshz3Q8CGV9 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Tshz3Q8CGV9 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tshz3Q8CGV9 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tshz3Q8CGV9 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tshz3Q8CGV9 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tshz3Q8CGV9 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tshz3Q8CGV9 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tshz3Q8CGV9 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tshz3Q8CGV9 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tshz3Q8CGV9 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tshz3Q8CGV9 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tshz3Q8CGV9 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tshz3Q8CGV9 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tshz3Q8CGV9 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tshz3Q8CGV9 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Tshz3Q8CGV9 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tshz3Q8CGV9 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tshz3Q8CGV9 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tshz3Q8CGV9 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Tshz3Q8CGV9 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tshz3Q8CGV9 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tshz3Q8CGV9 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tshz3Q8CGV9 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tshz3Q8CGV9 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Tshz3Q8CGV9 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Tshz3Q8CGV9 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Tshz3Q8CGV9 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Tshz3Q8CGV9 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Tshz3Q8CGV9 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Tshz3Q8CGV9 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Tshz3Q8CGV9 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tshz3Q8CGV9 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tshz3Q8CGV9 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tshz3Q8CGV9 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tshz3Q8CGV9 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tshz3Q8CGV9 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tshz3Q8CGV9 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tshz3Q8CGV9 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tshz3Q8CGV9 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tshz3Q8CGV9 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tshz3Q8CGV9 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tshz3Q8CGV9 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tshz3Q8CGV9 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Tshz3Q8CGV9 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Tshz3Q8CGV9 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Tshz3Q8CGV9 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Tshz3Q8CGV9 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Tshz3Q8CGV9 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Tshz3Q8CGV9 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Tshz3Q8CGV9 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Tshz3Q8CGV9 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Tshz3Q8CGV9 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Tshz3Q8CGV9 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms