Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFT2

Setd1b, Histone-lysine N-methyltransferase SETD1B, mousemouse

Predictions only

Length 1,985 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Setd1bQ8CFT2 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.16■■■□□ 2.9
Setd1bQ8CFT2 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
Setd1bQ8CFT2 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
Setd1bQ8CFT2 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC33.16■■■□□ 2.9
Setd1bQ8CFT2 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
Setd1bQ8CFT2 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
Setd1bQ8CFT2 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC33.15■■■□□ 2.9
Setd1bQ8CFT2 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.15■■■□□ 2.9
Setd1bQ8CFT2 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
Setd1bQ8CFT2 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
Setd1bQ8CFT2 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
Setd1bQ8CFT2 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.14■■■□□ 2.9
Setd1bQ8CFT2 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC33.14■■■□□ 2.9
Setd1bQ8CFT2 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
Setd1bQ8CFT2 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
Setd1bQ8CFT2 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
Setd1bQ8CFT2 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
Setd1bQ8CFT2 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC33.13■■■□□ 2.89
Setd1bQ8CFT2 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
Setd1bQ8CFT2 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
Setd1bQ8CFT2 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC33.13■■■□□ 2.89
Setd1bQ8CFT2 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.12■■■□□ 2.89
Setd1bQ8CFT2 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
Setd1bQ8CFT2 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
Setd1bQ8CFT2 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC33.12■■■□□ 2.89
Setd1bQ8CFT2 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
Setd1bQ8CFT2 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
Setd1bQ8CFT2 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
Setd1bQ8CFT2 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
Setd1bQ8CFT2 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC33.11■■■□□ 2.89
Setd1bQ8CFT2 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
Setd1bQ8CFT2 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC33.1■■■□□ 2.89
Setd1bQ8CFT2 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.1■■■□□ 2.89
Setd1bQ8CFT2 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
Setd1bQ8CFT2 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
Setd1bQ8CFT2 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
Setd1bQ8CFT2 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC33.09■■■□□ 2.89
Setd1bQ8CFT2 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC33.09■■■□□ 2.89
Setd1bQ8CFT2 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Setd1bQ8CFT2 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.09■■■□□ 2.89
Setd1bQ8CFT2 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Setd1bQ8CFT2 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Setd1bQ8CFT2 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Setd1bQ8CFT2 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Setd1bQ8CFT2 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC33.09■■■□□ 2.89
Setd1bQ8CFT2 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC33.08■■■□□ 2.89
Setd1bQ8CFT2 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
Setd1bQ8CFT2 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC33.08■■■□□ 2.89
Setd1bQ8CFT2 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC33.08■■■□□ 2.89
Setd1bQ8CFT2 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
Setd1bQ8CFT2 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
Setd1bQ8CFT2 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
Setd1bQ8CFT2 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
Setd1bQ8CFT2 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
Setd1bQ8CFT2 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
Setd1bQ8CFT2 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
Setd1bQ8CFT2 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
Setd1bQ8CFT2 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC33.04■■■□□ 2.88
Setd1bQ8CFT2 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
Setd1bQ8CFT2 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
Setd1bQ8CFT2 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC33.03■■■□□ 2.88
Setd1bQ8CFT2 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
Setd1bQ8CFT2 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC33.03■■■□□ 2.88
Setd1bQ8CFT2 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC33.03■■■□□ 2.88
Setd1bQ8CFT2 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC33.03■■■□□ 2.88
Setd1bQ8CFT2 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
Setd1bQ8CFT2 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC33.01■■■□□ 2.88
Setd1bQ8CFT2 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.88
Setd1bQ8CFT2 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.01■■■□□ 2.87
Setd1bQ8CFT2 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
Setd1bQ8CFT2 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
Setd1bQ8CFT2 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
Setd1bQ8CFT2 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC33■■■□□ 2.87
Setd1bQ8CFT2 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
Setd1bQ8CFT2 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33■■■□□ 2.87
Setd1bQ8CFT2 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
Setd1bQ8CFT2 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC33■■■□□ 2.87
Setd1bQ8CFT2 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC32.99■■■□□ 2.87
Setd1bQ8CFT2 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
Setd1bQ8CFT2 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
Setd1bQ8CFT2 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
Setd1bQ8CFT2 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
Setd1bQ8CFT2 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
Setd1bQ8CFT2 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
Setd1bQ8CFT2 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
Setd1bQ8CFT2 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
Setd1bQ8CFT2 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
Setd1bQ8CFT2 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC32.98■■■□□ 2.87
Setd1bQ8CFT2 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
Setd1bQ8CFT2 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
Setd1bQ8CFT2 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
Setd1bQ8CFT2 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
Setd1bQ8CFT2 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
Setd1bQ8CFT2 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
Setd1bQ8CFT2 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC32.96■■■□□ 2.87
Setd1bQ8CFT2 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.96■■■□□ 2.87
Setd1bQ8CFT2 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
Setd1bQ8CFT2 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
Setd1bQ8CFT2 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
Setd1bQ8CFT2 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC32.96■■■□□ 2.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms