Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEC0

Nup88, Nuclear pore complex protein Nup88, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup88Q8CEC0 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Nup88Q8CEC0 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Nup88Q8CEC0 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Nup88Q8CEC0 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Nup88Q8CEC0 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Nup88Q8CEC0 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Nup88Q8CEC0 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Nup88Q8CEC0 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Nup88Q8CEC0 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Nup88Q8CEC0 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Nup88Q8CEC0 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Nup88Q8CEC0 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Nup88Q8CEC0 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Nup88Q8CEC0 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Nup88Q8CEC0 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Nup88Q8CEC0 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Nup88Q8CEC0 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Nup88Q8CEC0 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Nup88Q8CEC0 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Nup88Q8CEC0 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Nup88Q8CEC0 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Nup88Q8CEC0 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Nup88Q8CEC0 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Nup88Q8CEC0 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Nup88Q8CEC0 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Nup88Q8CEC0 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Nup88Q8CEC0 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Nup88Q8CEC0 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Nup88Q8CEC0 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Nup88Q8CEC0 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Nup88Q8CEC0 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Nup88Q8CEC0 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Nup88Q8CEC0 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Nup88Q8CEC0 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Nup88Q8CEC0 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Nup88Q8CEC0 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Nup88Q8CEC0 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Nup88Q8CEC0 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Nup88Q8CEC0 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Nup88Q8CEC0 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Nup88Q8CEC0 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Nup88Q8CEC0 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Nup88Q8CEC0 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Nup88Q8CEC0 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Nup88Q8CEC0 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Nup88Q8CEC0 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Nup88Q8CEC0 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Nup88Q8CEC0 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Nup88Q8CEC0 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Nup88Q8CEC0 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Nup88Q8CEC0 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Nup88Q8CEC0 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Nup88Q8CEC0 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Nup88Q8CEC0 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Nup88Q8CEC0 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Nup88Q8CEC0 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Nup88Q8CEC0 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Nup88Q8CEC0 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Nup88Q8CEC0 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Nup88Q8CEC0 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Nup88Q8CEC0 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Nup88Q8CEC0 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Nup88Q8CEC0 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Nup88Q8CEC0 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Nup88Q8CEC0 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Nup88Q8CEC0 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Nup88Q8CEC0 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Nup88Q8CEC0 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Nup88Q8CEC0 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Nup88Q8CEC0 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Nup88Q8CEC0 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Nup88Q8CEC0 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Nup88Q8CEC0 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Nup88Q8CEC0 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Nup88Q8CEC0 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Nup88Q8CEC0 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Nup88Q8CEC0 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Nup88Q8CEC0 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Nup88Q8CEC0 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Nup88Q8CEC0 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Nup88Q8CEC0 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Nup88Q8CEC0 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Nup88Q8CEC0 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Nup88Q8CEC0 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Nup88Q8CEC0 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Nup88Q8CEC0 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Nup88Q8CEC0 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Nup88Q8CEC0 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Nup88Q8CEC0 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Nup88Q8CEC0 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Nup88Q8CEC0 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Nup88Q8CEC0 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Nup88Q8CEC0 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Nup88Q8CEC0 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Nup88Q8CEC0 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Nup88Q8CEC0 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Nup88Q8CEC0 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Nup88Q8CEC0 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Nup88Q8CEC0 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Nup88Q8CEC0 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms