Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9W1

A430089I19Rik, RIKEN cDNA A430089I19 gene, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A430089I19RikQ8C9W1 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
A430089I19RikQ8C9W1 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
A430089I19RikQ8C9W1 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
A430089I19RikQ8C9W1 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
A430089I19RikQ8C9W1 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
A430089I19RikQ8C9W1 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
A430089I19RikQ8C9W1 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
A430089I19RikQ8C9W1 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
A430089I19RikQ8C9W1 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
A430089I19RikQ8C9W1 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
A430089I19RikQ8C9W1 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
A430089I19RikQ8C9W1 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
A430089I19RikQ8C9W1 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
A430089I19RikQ8C9W1 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
A430089I19RikQ8C9W1 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
A430089I19RikQ8C9W1 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
A430089I19RikQ8C9W1 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
A430089I19RikQ8C9W1 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
A430089I19RikQ8C9W1 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
A430089I19RikQ8C9W1 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
A430089I19RikQ8C9W1 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
A430089I19RikQ8C9W1 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
A430089I19RikQ8C9W1 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
A430089I19RikQ8C9W1 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
A430089I19RikQ8C9W1 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
A430089I19RikQ8C9W1 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
A430089I19RikQ8C9W1 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
A430089I19RikQ8C9W1 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
A430089I19RikQ8C9W1 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
A430089I19RikQ8C9W1 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
A430089I19RikQ8C9W1 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
A430089I19RikQ8C9W1 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
A430089I19RikQ8C9W1 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
A430089I19RikQ8C9W1 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
A430089I19RikQ8C9W1 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
A430089I19RikQ8C9W1 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
A430089I19RikQ8C9W1 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
A430089I19RikQ8C9W1 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
A430089I19RikQ8C9W1 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
A430089I19RikQ8C9W1 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
A430089I19RikQ8C9W1 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
A430089I19RikQ8C9W1 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
A430089I19RikQ8C9W1 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
A430089I19RikQ8C9W1 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
A430089I19RikQ8C9W1 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
A430089I19RikQ8C9W1 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
A430089I19RikQ8C9W1 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
A430089I19RikQ8C9W1 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
A430089I19RikQ8C9W1 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
A430089I19RikQ8C9W1 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
A430089I19RikQ8C9W1 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
A430089I19RikQ8C9W1 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
A430089I19RikQ8C9W1 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
A430089I19RikQ8C9W1 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
A430089I19RikQ8C9W1 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
A430089I19RikQ8C9W1 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
A430089I19RikQ8C9W1 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
A430089I19RikQ8C9W1 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
A430089I19RikQ8C9W1 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
A430089I19RikQ8C9W1 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
A430089I19RikQ8C9W1 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
A430089I19RikQ8C9W1 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
A430089I19RikQ8C9W1 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
A430089I19RikQ8C9W1 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
A430089I19RikQ8C9W1 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
A430089I19RikQ8C9W1 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
A430089I19RikQ8C9W1 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
A430089I19RikQ8C9W1 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
A430089I19RikQ8C9W1 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
A430089I19RikQ8C9W1 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
A430089I19RikQ8C9W1 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
A430089I19RikQ8C9W1 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
A430089I19RikQ8C9W1 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
A430089I19RikQ8C9W1 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
A430089I19RikQ8C9W1 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
A430089I19RikQ8C9W1 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
A430089I19RikQ8C9W1 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
A430089I19RikQ8C9W1 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
A430089I19RikQ8C9W1 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
A430089I19RikQ8C9W1 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
A430089I19RikQ8C9W1 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
A430089I19RikQ8C9W1 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
A430089I19RikQ8C9W1 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
A430089I19RikQ8C9W1 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
A430089I19RikQ8C9W1 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
A430089I19RikQ8C9W1 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
A430089I19RikQ8C9W1 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
A430089I19RikQ8C9W1 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
A430089I19RikQ8C9W1 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
A430089I19RikQ8C9W1 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
A430089I19RikQ8C9W1 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
A430089I19RikQ8C9W1 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
A430089I19RikQ8C9W1 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
A430089I19RikQ8C9W1 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
A430089I19RikQ8C9W1 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
A430089I19RikQ8C9W1 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
A430089I19RikQ8C9W1 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
A430089I19RikQ8C9W1 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
A430089I19RikQ8C9W1 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
A430089I19RikQ8C9W1 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms