Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5L3

Cnot2, CCR4-NOT transcription complex subunit 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 540 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot2Q8C5L3 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cnot2Q8C5L3 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cnot2Q8C5L3 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cnot2Q8C5L3 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cnot2Q8C5L3 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cnot2Q8C5L3 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cnot2Q8C5L3 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cnot2Q8C5L3 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cnot2Q8C5L3 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cnot2Q8C5L3 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cnot2Q8C5L3 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cnot2Q8C5L3 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cnot2Q8C5L3 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cnot2Q8C5L3 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cnot2Q8C5L3 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cnot2Q8C5L3 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cnot2Q8C5L3 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cnot2Q8C5L3 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cnot2Q8C5L3 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cnot2Q8C5L3 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cnot2Q8C5L3 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cnot2Q8C5L3 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cnot2Q8C5L3 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cnot2Q8C5L3 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cnot2Q8C5L3 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cnot2Q8C5L3 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cnot2Q8C5L3 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cnot2Q8C5L3 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Cnot2Q8C5L3 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cnot2Q8C5L3 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cnot2Q8C5L3 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cnot2Q8C5L3 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cnot2Q8C5L3 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cnot2Q8C5L3 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cnot2Q8C5L3 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cnot2Q8C5L3 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cnot2Q8C5L3 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cnot2Q8C5L3 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cnot2Q8C5L3 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cnot2Q8C5L3 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cnot2Q8C5L3 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cnot2Q8C5L3 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cnot2Q8C5L3 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cnot2Q8C5L3 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cnot2Q8C5L3 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cnot2Q8C5L3 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cnot2Q8C5L3 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cnot2Q8C5L3 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cnot2Q8C5L3 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cnot2Q8C5L3 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cnot2Q8C5L3 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cnot2Q8C5L3 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cnot2Q8C5L3 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cnot2Q8C5L3 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cnot2Q8C5L3 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cnot2Q8C5L3 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cnot2Q8C5L3 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cnot2Q8C5L3 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cnot2Q8C5L3 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cnot2Q8C5L3 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cnot2Q8C5L3 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cnot2Q8C5L3 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Cnot2Q8C5L3 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cnot2Q8C5L3 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cnot2Q8C5L3 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cnot2Q8C5L3 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Cnot2Q8C5L3 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Cnot2Q8C5L3 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Cnot2Q8C5L3 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cnot2Q8C5L3 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cnot2Q8C5L3 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cnot2Q8C5L3 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cnot2Q8C5L3 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cnot2Q8C5L3 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cnot2Q8C5L3 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cnot2Q8C5L3 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cnot2Q8C5L3 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cnot2Q8C5L3 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Cnot2Q8C5L3 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cnot2Q8C5L3 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cnot2Q8C5L3 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cnot2Q8C5L3 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cnot2Q8C5L3 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cnot2Q8C5L3 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cnot2Q8C5L3 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cnot2Q8C5L3 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cnot2Q8C5L3 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cnot2Q8C5L3 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cnot2Q8C5L3 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cnot2Q8C5L3 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cnot2Q8C5L3 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cnot2Q8C5L3 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cnot2Q8C5L3 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cnot2Q8C5L3 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cnot2Q8C5L3 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cnot2Q8C5L3 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cnot2Q8C5L3 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cnot2Q8C5L3 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cnot2Q8C5L3 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cnot2Q8C5L3 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms