Protein–RNA interactions for Protein: Q8C1R3

Uncharacterized protein C17orf50 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8C1R3 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Q8C1R3 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Q8C1R3 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Q8C1R3 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Q8C1R3 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Q8C1R3 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Q8C1R3 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Q8C1R3 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Q8C1R3 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Q8C1R3 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Q8C1R3 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Q8C1R3 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Q8C1R3 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Q8C1R3 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Q8C1R3 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Q8C1R3 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Q8C1R3 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Q8C1R3 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Q8C1R3 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Q8C1R3 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Q8C1R3 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Q8C1R3 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Q8C1R3 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Q8C1R3 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Q8C1R3 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Q8C1R3 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Q8C1R3 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Q8C1R3 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Q8C1R3 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Q8C1R3 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Q8C1R3 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Q8C1R3 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Q8C1R3 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Q8C1R3 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Q8C1R3 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Q8C1R3 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Q8C1R3 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Q8C1R3 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Q8C1R3 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Q8C1R3 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Q8C1R3 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Q8C1R3 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Q8C1R3 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Q8C1R3 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Q8C1R3 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Q8C1R3 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Q8C1R3 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Q8C1R3 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Q8C1R3 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Q8C1R3 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Q8C1R3 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Q8C1R3 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Q8C1R3 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Q8C1R3 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Q8C1R3 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Q8C1R3 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Q8C1R3 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Q8C1R3 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Q8C1R3 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Q8C1R3 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Q8C1R3 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Q8C1R3 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Q8C1R3 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Q8C1R3 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Q8C1R3 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Q8C1R3 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Q8C1R3 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Q8C1R3 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Q8C1R3 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Q8C1R3 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Q8C1R3 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Q8C1R3 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Q8C1R3 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Q8C1R3 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Q8C1R3 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Q8C1R3 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Q8C1R3 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Q8C1R3 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Q8C1R3 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Q8C1R3 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Q8C1R3 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Q8C1R3 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Q8C1R3 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Q8C1R3 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Q8C1R3 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Q8C1R3 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Q8C1R3 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Q8C1R3 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Q8C1R3 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Q8C1R3 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Q8C1R3 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Q8C1R3 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Q8C1R3 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Q8C1R3 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Q8C1R3 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Q8C1R3 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Q8C1R3 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Q8C1R3 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Q8C1R3 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Q8C1R3 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms