Protein–RNA interactions for Protein: Q8C1M2

Znf428, Zinc finger protein 428, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf428Q8C1M2 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Znf428Q8C1M2 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Znf428Q8C1M2 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Znf428Q8C1M2 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Znf428Q8C1M2 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Znf428Q8C1M2 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Znf428Q8C1M2 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Znf428Q8C1M2 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Znf428Q8C1M2 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Znf428Q8C1M2 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Znf428Q8C1M2 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Znf428Q8C1M2 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Znf428Q8C1M2 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Znf428Q8C1M2 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Znf428Q8C1M2 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Znf428Q8C1M2 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Znf428Q8C1M2 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Znf428Q8C1M2 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Znf428Q8C1M2 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Znf428Q8C1M2 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Znf428Q8C1M2 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Znf428Q8C1M2 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Znf428Q8C1M2 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Znf428Q8C1M2 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Znf428Q8C1M2 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Znf428Q8C1M2 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Znf428Q8C1M2 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Znf428Q8C1M2 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Znf428Q8C1M2 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Znf428Q8C1M2 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Znf428Q8C1M2 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Znf428Q8C1M2 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Znf428Q8C1M2 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Znf428Q8C1M2 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Znf428Q8C1M2 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Znf428Q8C1M2 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Znf428Q8C1M2 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Znf428Q8C1M2 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Znf428Q8C1M2 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Znf428Q8C1M2 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Znf428Q8C1M2 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Znf428Q8C1M2 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Znf428Q8C1M2 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Znf428Q8C1M2 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Znf428Q8C1M2 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Znf428Q8C1M2 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Znf428Q8C1M2 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Znf428Q8C1M2 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Znf428Q8C1M2 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Znf428Q8C1M2 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Znf428Q8C1M2 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Znf428Q8C1M2 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Znf428Q8C1M2 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Znf428Q8C1M2 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Znf428Q8C1M2 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Znf428Q8C1M2 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Znf428Q8C1M2 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Znf428Q8C1M2 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Znf428Q8C1M2 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Znf428Q8C1M2 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Znf428Q8C1M2 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Znf428Q8C1M2 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Znf428Q8C1M2 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Znf428Q8C1M2 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Znf428Q8C1M2 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Znf428Q8C1M2 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Znf428Q8C1M2 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Znf428Q8C1M2 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Znf428Q8C1M2 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Znf428Q8C1M2 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Znf428Q8C1M2 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Znf428Q8C1M2 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Znf428Q8C1M2 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Znf428Q8C1M2 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Znf428Q8C1M2 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Znf428Q8C1M2 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Znf428Q8C1M2 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Znf428Q8C1M2 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Znf428Q8C1M2 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Znf428Q8C1M2 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Znf428Q8C1M2 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Znf428Q8C1M2 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Znf428Q8C1M2 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Znf428Q8C1M2 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Znf428Q8C1M2 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Znf428Q8C1M2 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Znf428Q8C1M2 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Znf428Q8C1M2 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Znf428Q8C1M2 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Znf428Q8C1M2 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Znf428Q8C1M2 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Znf428Q8C1M2 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Znf428Q8C1M2 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Znf428Q8C1M2 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Znf428Q8C1M2 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Znf428Q8C1M2 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Znf428Q8C1M2 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Znf428Q8C1M2 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Znf428Q8C1M2 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Znf428Q8C1M2 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
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