Protein–RNA interactions for Protein: Q8BSQ9

Pbrm1, Protein polybromo-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pbrm1Q8BSQ9 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
Pbrm1Q8BSQ9 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
Pbrm1Q8BSQ9 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
Pbrm1Q8BSQ9 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
Pbrm1Q8BSQ9 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
Pbrm1Q8BSQ9 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
Pbrm1Q8BSQ9 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
Pbrm1Q8BSQ9 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC33.12■■■□□ 2.89
Pbrm1Q8BSQ9 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
Pbrm1Q8BSQ9 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
Pbrm1Q8BSQ9 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.11■■■□□ 2.89
Pbrm1Q8BSQ9 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
Pbrm1Q8BSQ9 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
Pbrm1Q8BSQ9 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC33.1■■■□□ 2.89
Pbrm1Q8BSQ9 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC33.1■■■□□ 2.89
Pbrm1Q8BSQ9 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Pbrm1Q8BSQ9 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Pbrm1Q8BSQ9 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC33.09■■■□□ 2.89
Pbrm1Q8BSQ9 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.09■■■□□ 2.89
Pbrm1Q8BSQ9 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC33.08■■■□□ 2.89
Pbrm1Q8BSQ9 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
Pbrm1Q8BSQ9 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
Pbrm1Q8BSQ9 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
Pbrm1Q8BSQ9 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.89
Pbrm1Q8BSQ9 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.89
Pbrm1Q8BSQ9 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.07■■■□□ 2.88
Pbrm1Q8BSQ9 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
Pbrm1Q8BSQ9 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
Pbrm1Q8BSQ9 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
Pbrm1Q8BSQ9 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC33.06■■■□□ 2.88
Pbrm1Q8BSQ9 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC33.06■■■□□ 2.88
Pbrm1Q8BSQ9 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC33.06■■■□□ 2.88
Pbrm1Q8BSQ9 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
Pbrm1Q8BSQ9 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
Pbrm1Q8BSQ9 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC33.06■■■□□ 2.88
Pbrm1Q8BSQ9 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
Pbrm1Q8BSQ9 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
Pbrm1Q8BSQ9 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC33.05■■■□□ 2.88
Pbrm1Q8BSQ9 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
Pbrm1Q8BSQ9 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC33.05■■■□□ 2.88
Pbrm1Q8BSQ9 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.05■■■□□ 2.88
Pbrm1Q8BSQ9 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
Pbrm1Q8BSQ9 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
Pbrm1Q8BSQ9 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
Pbrm1Q8BSQ9 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
Pbrm1Q8BSQ9 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
Pbrm1Q8BSQ9 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC33.04■■■□□ 2.88
Pbrm1Q8BSQ9 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.04■■■□□ 2.88
Pbrm1Q8BSQ9 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC33.04■■■□□ 2.88
Pbrm1Q8BSQ9 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC33.04■■■□□ 2.88
Pbrm1Q8BSQ9 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
Pbrm1Q8BSQ9 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
Pbrm1Q8BSQ9 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
Pbrm1Q8BSQ9 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
Pbrm1Q8BSQ9 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
Pbrm1Q8BSQ9 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
Pbrm1Q8BSQ9 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
Pbrm1Q8BSQ9 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
Pbrm1Q8BSQ9 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
Pbrm1Q8BSQ9 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
Pbrm1Q8BSQ9 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC33.02■■■□□ 2.88
Pbrm1Q8BSQ9 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC33.02■■■□□ 2.88
Pbrm1Q8BSQ9 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
Pbrm1Q8BSQ9 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
Pbrm1Q8BSQ9 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
Pbrm1Q8BSQ9 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
Pbrm1Q8BSQ9 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC33.01■■■□□ 2.87
Pbrm1Q8BSQ9 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
Pbrm1Q8BSQ9 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC33.01■■■□□ 2.87
Pbrm1Q8BSQ9 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
Pbrm1Q8BSQ9 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
Pbrm1Q8BSQ9 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
Pbrm1Q8BSQ9 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
Pbrm1Q8BSQ9 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
Pbrm1Q8BSQ9 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
Pbrm1Q8BSQ9 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
Pbrm1Q8BSQ9 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
Pbrm1Q8BSQ9 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
Pbrm1Q8BSQ9 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC32.99■■■□□ 2.87
Pbrm1Q8BSQ9 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC32.99■■■□□ 2.87
Pbrm1Q8BSQ9 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
Pbrm1Q8BSQ9 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
Pbrm1Q8BSQ9 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
Pbrm1Q8BSQ9 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
Pbrm1Q8BSQ9 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
Pbrm1Q8BSQ9 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC32.97■■■□□ 2.87
Pbrm1Q8BSQ9 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
Pbrm1Q8BSQ9 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
Pbrm1Q8BSQ9 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
Pbrm1Q8BSQ9 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC32.96■■■□□ 2.87
Pbrm1Q8BSQ9 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
Pbrm1Q8BSQ9 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
Pbrm1Q8BSQ9 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
Pbrm1Q8BSQ9 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
Pbrm1Q8BSQ9 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
Pbrm1Q8BSQ9 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
Pbrm1Q8BSQ9 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.86
Pbrm1Q8BSQ9 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.86
Pbrm1Q8BSQ9 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.94■■■□□ 2.86
Pbrm1Q8BSQ9 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC32.94■■■□□ 2.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms