Protein–RNA interactions for Protein: Q8BFU8

Slc17a8, Vesicular glutamate transporter 3, mousemouse

Predictions only

Length 601 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc17a8Q8BFU8 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Slc17a8Q8BFU8 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Slc17a8Q8BFU8 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Slc17a8Q8BFU8 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Slc17a8Q8BFU8 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Slc17a8Q8BFU8 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Slc17a8Q8BFU8 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Slc17a8Q8BFU8 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Slc17a8Q8BFU8 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Slc17a8Q8BFU8 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Slc17a8Q8BFU8 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Slc17a8Q8BFU8 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Slc17a8Q8BFU8 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Slc17a8Q8BFU8 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Slc17a8Q8BFU8 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Slc17a8Q8BFU8 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Slc17a8Q8BFU8 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Slc17a8Q8BFU8 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Slc17a8Q8BFU8 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Slc17a8Q8BFU8 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Slc17a8Q8BFU8 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Slc17a8Q8BFU8 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Slc17a8Q8BFU8 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Slc17a8Q8BFU8 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Slc17a8Q8BFU8 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Slc17a8Q8BFU8 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Slc17a8Q8BFU8 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Slc17a8Q8BFU8 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Slc17a8Q8BFU8 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Slc17a8Q8BFU8 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Slc17a8Q8BFU8 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Slc17a8Q8BFU8 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Slc17a8Q8BFU8 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Slc17a8Q8BFU8 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Slc17a8Q8BFU8 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Slc17a8Q8BFU8 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Slc17a8Q8BFU8 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Slc17a8Q8BFU8 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Slc17a8Q8BFU8 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Slc17a8Q8BFU8 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Slc17a8Q8BFU8 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Slc17a8Q8BFU8 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Slc17a8Q8BFU8 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Slc17a8Q8BFU8 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Slc17a8Q8BFU8 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Slc17a8Q8BFU8 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Slc17a8Q8BFU8 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Slc17a8Q8BFU8 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Slc17a8Q8BFU8 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Slc17a8Q8BFU8 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Slc17a8Q8BFU8 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Slc17a8Q8BFU8 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Slc17a8Q8BFU8 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Slc17a8Q8BFU8 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Slc17a8Q8BFU8 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Slc17a8Q8BFU8 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Slc17a8Q8BFU8 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Slc17a8Q8BFU8 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Slc17a8Q8BFU8 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Slc17a8Q8BFU8 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Slc17a8Q8BFU8 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Slc17a8Q8BFU8 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Slc17a8Q8BFU8 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Slc17a8Q8BFU8 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Slc17a8Q8BFU8 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Slc17a8Q8BFU8 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Slc17a8Q8BFU8 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Slc17a8Q8BFU8 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Slc17a8Q8BFU8 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Slc17a8Q8BFU8 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Slc17a8Q8BFU8 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Slc17a8Q8BFU8 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Slc17a8Q8BFU8 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Slc17a8Q8BFU8 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Slc17a8Q8BFU8 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Slc17a8Q8BFU8 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Slc17a8Q8BFU8 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Slc17a8Q8BFU8 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Slc17a8Q8BFU8 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Slc17a8Q8BFU8 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Slc17a8Q8BFU8 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Slc17a8Q8BFU8 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Slc17a8Q8BFU8 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Slc17a8Q8BFU8 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Slc17a8Q8BFU8 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Slc17a8Q8BFU8 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Slc17a8Q8BFU8 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Slc17a8Q8BFU8 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Slc17a8Q8BFU8 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Slc17a8Q8BFU8 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Slc17a8Q8BFU8 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Slc17a8Q8BFU8 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Slc17a8Q8BFU8 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Slc17a8Q8BFU8 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Slc17a8Q8BFU8 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Slc17a8Q8BFU8 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Slc17a8Q8BFU8 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Slc17a8Q8BFU8 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Slc17a8Q8BFU8 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Slc17a8Q8BFU8 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms