Protein–RNA interactions for Protein: Q80TM9

Nisch, Nischarin, mousemouse

Predictions only

Length 1,593 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NischQ80TM9 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC44.09■■■■■ 4.65
NischQ80TM9 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC44.09■■■■■ 4.65
NischQ80TM9 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC44.09■■■■■ 4.65
NischQ80TM9 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.08■■■■■ 4.65
NischQ80TM9 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC44.08■■■■■ 4.65
NischQ80TM9 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.08■■■■■ 4.65
NischQ80TM9 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC44.07■■■■■ 4.65
NischQ80TM9 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC44.07■■■■■ 4.65
NischQ80TM9 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC44.07■■■■■ 4.65
NischQ80TM9 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC44.06■■■■■ 4.64
NischQ80TM9 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.06■■■■■ 4.64
NischQ80TM9 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC44.06■■■■■ 4.64
NischQ80TM9 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC44.06■■■■■ 4.64
NischQ80TM9 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.06■■■■■ 4.64
NischQ80TM9 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.05■■■■■ 4.64
NischQ80TM9 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC44.05■■■■■ 4.64
NischQ80TM9 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC44.05■■■■■ 4.64
NischQ80TM9 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC44.04■■■■■ 4.64
NischQ80TM9 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC44.04■■■■■ 4.64
NischQ80TM9 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC44.04■■■■■ 4.64
NischQ80TM9 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.04■■■■■ 4.64
NischQ80TM9 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC44.03■■■■■ 4.64
NischQ80TM9 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC44.03■■■■■ 4.64
NischQ80TM9 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.03■■■■■ 4.64
NischQ80TM9 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC44.03■■■■■ 4.64
NischQ80TM9 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.02■■■■■ 4.64
NischQ80TM9 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.02■■■■■ 4.64
NischQ80TM9 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC44.02■■■■■ 4.64
NischQ80TM9 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC44.02■■■■■ 4.64
NischQ80TM9 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC44.01■■■■■ 4.64
NischQ80TM9 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC44.01■■■■■ 4.64
NischQ80TM9 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC44.01■■■■■ 4.64
NischQ80TM9 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC44.01■■■■■ 4.64
NischQ80TM9 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44■■■■■ 4.63
NischQ80TM9 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44■■■■■ 4.63
NischQ80TM9 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC44■■■■■ 4.63
NischQ80TM9 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC44■■■■■ 4.63
NischQ80TM9 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44■■■■■ 4.63
NischQ80TM9 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC43.99■■■■■ 4.63
NischQ80TM9 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC43.99■■■■■ 4.63
NischQ80TM9 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.98■■■■■ 4.63
NischQ80TM9 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC43.98■■■■■ 4.63
NischQ80TM9 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.98■■■■■ 4.63
NischQ80TM9 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC43.97■■■■■ 4.63
NischQ80TM9 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.97■■■■■ 4.63
NischQ80TM9 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.97■■■■■ 4.63
NischQ80TM9 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC43.97■■■■■ 4.63
NischQ80TM9 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.97■■■■■ 4.63
NischQ80TM9 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC43.97■■■■■ 4.63
NischQ80TM9 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.96■■■■■ 4.63
NischQ80TM9 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.96■■■■■ 4.63
NischQ80TM9 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC43.95■■■■■ 4.63
NischQ80TM9 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.95■■■■■ 4.63
NischQ80TM9 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.95■■■■■ 4.63
NischQ80TM9 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.94■■■■■ 4.62
NischQ80TM9 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.94■■■■■ 4.62
NischQ80TM9 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.94■■■■■ 4.62
NischQ80TM9 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.94■■■■■ 4.62
NischQ80TM9 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.93■■■■■ 4.62
NischQ80TM9 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC43.93■■■■■ 4.62
NischQ80TM9 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC43.93■■■■■ 4.62
NischQ80TM9 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC43.93■■■■■ 4.62
NischQ80TM9 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC43.93■■■■■ 4.62
NischQ80TM9 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC43.92■■■■■ 4.62
NischQ80TM9 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.92■■■■■ 4.62
NischQ80TM9 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC43.92■■■■■ 4.62
NischQ80TM9 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.92■■■■■ 4.62
NischQ80TM9 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC43.92■■■■■ 4.62
NischQ80TM9 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC43.91■■■■■ 4.62
NischQ80TM9 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.91■■■■■ 4.62
NischQ80TM9 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.91■■■■■ 4.62
NischQ80TM9 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC43.91■■■■■ 4.62
NischQ80TM9 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.9■■■■■ 4.62
NischQ80TM9 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.89■■■■■ 4.62
NischQ80TM9 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC43.89■■■■■ 4.62
NischQ80TM9 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.88■■■■■ 4.62
NischQ80TM9 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC43.88■■■■■ 4.62
NischQ80TM9 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC43.88■■■■■ 4.62
NischQ80TM9 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC43.88■■■■■ 4.61
NischQ80TM9 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.88■■■■■ 4.61
NischQ80TM9 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.88■■■■■ 4.61
NischQ80TM9 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.88■■■■■ 4.61
NischQ80TM9 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC43.88■■■■■ 4.61
NischQ80TM9 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.87■■■■■ 4.61
NischQ80TM9 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.85■■■■■ 4.61
NischQ80TM9 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.85■■■■■ 4.61
NischQ80TM9 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.85■■■■■ 4.61
NischQ80TM9 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.84■■■■■ 4.61
NischQ80TM9 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.84■■■■■ 4.61
NischQ80TM9 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.84■■■■■ 4.61
NischQ80TM9 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.83■■■■■ 4.61
NischQ80TM9 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.82■■■■■ 4.61
NischQ80TM9 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.82■■■■■ 4.61
NischQ80TM9 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC43.82■■■■■ 4.61
NischQ80TM9 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC43.82■■■■■ 4.61
NischQ80TM9 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC43.82■■■■■ 4.61
NischQ80TM9 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC43.81■■■■■ 4.6
NischQ80TM9 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.81■■■■■ 4.6
NischQ80TM9 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC43.81■■■■■ 4.6
NischQ80TM9 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.81■■■■■ 4.6
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