Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSG2

Ctdp1, RNA polymerase II subunit A C-terminal domain phosphatase, mousemouse

Predictions only

Length 960 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdp1Q7TSG2 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ctdp1Q7TSG2 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ctdp1Q7TSG2 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Ctdp1Q7TSG2 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ctdp1Q7TSG2 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ctdp1Q7TSG2 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ctdp1Q7TSG2 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ctdp1Q7TSG2 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ctdp1Q7TSG2 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ctdp1Q7TSG2 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ctdp1Q7TSG2 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ctdp1Q7TSG2 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ctdp1Q7TSG2 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ctdp1Q7TSG2 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ctdp1Q7TSG2 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ctdp1Q7TSG2 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ctdp1Q7TSG2 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ctdp1Q7TSG2 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ctdp1Q7TSG2 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ctdp1Q7TSG2 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ctdp1Q7TSG2 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ctdp1Q7TSG2 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ctdp1Q7TSG2 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ctdp1Q7TSG2 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ctdp1Q7TSG2 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ctdp1Q7TSG2 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ctdp1Q7TSG2 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ctdp1Q7TSG2 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ctdp1Q7TSG2 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ctdp1Q7TSG2 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ctdp1Q7TSG2 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ctdp1Q7TSG2 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ctdp1Q7TSG2 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ctdp1Q7TSG2 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ctdp1Q7TSG2 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ctdp1Q7TSG2 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ctdp1Q7TSG2 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Ctdp1Q7TSG2 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ctdp1Q7TSG2 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ctdp1Q7TSG2 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ctdp1Q7TSG2 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ctdp1Q7TSG2 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ctdp1Q7TSG2 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ctdp1Q7TSG2 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ctdp1Q7TSG2 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ctdp1Q7TSG2 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ctdp1Q7TSG2 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ctdp1Q7TSG2 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ctdp1Q7TSG2 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ctdp1Q7TSG2 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ctdp1Q7TSG2 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ctdp1Q7TSG2 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ctdp1Q7TSG2 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ctdp1Q7TSG2 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ctdp1Q7TSG2 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ctdp1Q7TSG2 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ctdp1Q7TSG2 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ctdp1Q7TSG2 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ctdp1Q7TSG2 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ctdp1Q7TSG2 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Ctdp1Q7TSG2 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ctdp1Q7TSG2 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ctdp1Q7TSG2 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ctdp1Q7TSG2 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Ctdp1Q7TSG2 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ctdp1Q7TSG2 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ctdp1Q7TSG2 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ctdp1Q7TSG2 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Ctdp1Q7TSG2 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ctdp1Q7TSG2 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ctdp1Q7TSG2 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ctdp1Q7TSG2 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ctdp1Q7TSG2 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ctdp1Q7TSG2 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ctdp1Q7TSG2 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ctdp1Q7TSG2 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ctdp1Q7TSG2 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ctdp1Q7TSG2 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ctdp1Q7TSG2 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ctdp1Q7TSG2 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ctdp1Q7TSG2 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Ctdp1Q7TSG2 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Ctdp1Q7TSG2 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ctdp1Q7TSG2 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ctdp1Q7TSG2 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ctdp1Q7TSG2 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ctdp1Q7TSG2 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ctdp1Q7TSG2 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ctdp1Q7TSG2 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ctdp1Q7TSG2 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ctdp1Q7TSG2 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ctdp1Q7TSG2 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ctdp1Q7TSG2 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ctdp1Q7TSG2 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ctdp1Q7TSG2 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ctdp1Q7TSG2 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ctdp1Q7TSG2 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ctdp1Q7TSG2 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ctdp1Q7TSG2 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ctdp1Q7TSG2 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms