Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWS8

Spop, Speckle-type POZ protein, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SpopQ6ZWS8 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SpopQ6ZWS8 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SpopQ6ZWS8 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
SpopQ6ZWS8 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
SpopQ6ZWS8 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
SpopQ6ZWS8 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SpopQ6ZWS8 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
SpopQ6ZWS8 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SpopQ6ZWS8 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SpopQ6ZWS8 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SpopQ6ZWS8 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SpopQ6ZWS8 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SpopQ6ZWS8 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SpopQ6ZWS8 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SpopQ6ZWS8 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SpopQ6ZWS8 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SpopQ6ZWS8 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
SpopQ6ZWS8 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SpopQ6ZWS8 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SpopQ6ZWS8 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SpopQ6ZWS8 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SpopQ6ZWS8 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SpopQ6ZWS8 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SpopQ6ZWS8 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SpopQ6ZWS8 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SpopQ6ZWS8 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SpopQ6ZWS8 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SpopQ6ZWS8 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SpopQ6ZWS8 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SpopQ6ZWS8 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SpopQ6ZWS8 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SpopQ6ZWS8 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SpopQ6ZWS8 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SpopQ6ZWS8 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SpopQ6ZWS8 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SpopQ6ZWS8 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SpopQ6ZWS8 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SpopQ6ZWS8 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SpopQ6ZWS8 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SpopQ6ZWS8 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SpopQ6ZWS8 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SpopQ6ZWS8 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SpopQ6ZWS8 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SpopQ6ZWS8 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SpopQ6ZWS8 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SpopQ6ZWS8 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SpopQ6ZWS8 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SpopQ6ZWS8 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SpopQ6ZWS8 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SpopQ6ZWS8 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SpopQ6ZWS8 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SpopQ6ZWS8 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SpopQ6ZWS8 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SpopQ6ZWS8 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
SpopQ6ZWS8 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SpopQ6ZWS8 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SpopQ6ZWS8 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SpopQ6ZWS8 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SpopQ6ZWS8 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SpopQ6ZWS8 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SpopQ6ZWS8 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
SpopQ6ZWS8 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SpopQ6ZWS8 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SpopQ6ZWS8 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SpopQ6ZWS8 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SpopQ6ZWS8 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SpopQ6ZWS8 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SpopQ6ZWS8 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SpopQ6ZWS8 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SpopQ6ZWS8 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SpopQ6ZWS8 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SpopQ6ZWS8 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SpopQ6ZWS8 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SpopQ6ZWS8 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SpopQ6ZWS8 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SpopQ6ZWS8 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SpopQ6ZWS8 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SpopQ6ZWS8 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SpopQ6ZWS8 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SpopQ6ZWS8 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SpopQ6ZWS8 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SpopQ6ZWS8 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SpopQ6ZWS8 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SpopQ6ZWS8 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SpopQ6ZWS8 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SpopQ6ZWS8 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SpopQ6ZWS8 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SpopQ6ZWS8 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SpopQ6ZWS8 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SpopQ6ZWS8 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SpopQ6ZWS8 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SpopQ6ZWS8 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SpopQ6ZWS8 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SpopQ6ZWS8 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SpopQ6ZWS8 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SpopQ6ZWS8 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SpopQ6ZWS8 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SpopQ6ZWS8 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SpopQ6ZWS8 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SpopQ6ZWS8 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.6 ms