Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWQ0

Syne2, Nesprin-2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 6,874 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syne2Q6ZWQ0 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC9.41□□□□□ -0.9
Syne2Q6ZWQ0 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC9.41□□□□□ -0.9
Syne2Q6ZWQ0 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.41□□□□□ -0.9
Syne2Q6ZWQ0 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Syne2Q6ZWQ0 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Syne2Q6ZWQ0 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC9.41□□□□□ -0.9
Syne2Q6ZWQ0 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC9.41□□□□□ -0.9
Syne2Q6ZWQ0 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Syne2Q6ZWQ0 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Syne2Q6ZWQ0 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC9.41□□□□□ -0.9
Syne2Q6ZWQ0 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Syne2Q6ZWQ0 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC9.4□□□□□ -0.9
Syne2Q6ZWQ0 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC9.4□□□□□ -0.9
Syne2Q6ZWQ0 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Syne2Q6ZWQ0 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Syne2Q6ZWQ0 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Syne2Q6ZWQ0 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Syne2Q6ZWQ0 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Syne2Q6ZWQ0 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.9
Syne2Q6ZWQ0 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.9
Syne2Q6ZWQ0 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Syne2Q6ZWQ0 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
Syne2Q6ZWQ0 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
Syne2Q6ZWQ0 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
Syne2Q6ZWQ0 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC9.4□□□□□ -0.91
Syne2Q6ZWQ0 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.91
Syne2Q6ZWQ0 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Syne2Q6ZWQ0 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
Syne2Q6ZWQ0 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Syne2Q6ZWQ0 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Syne2Q6ZWQ0 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Syne2Q6ZWQ0 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Syne2Q6ZWQ0 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Syne2Q6ZWQ0 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Syne2Q6ZWQ0 Mkl2-203ENSMUST00000115809 667 ntTSL 2 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Syne2Q6ZWQ0 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Syne2Q6ZWQ0 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Syne2Q6ZWQ0 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Syne2Q6ZWQ0 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Syne2Q6ZWQ0 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
Syne2Q6ZWQ0 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC9.38□□□□□ -0.91
Syne2Q6ZWQ0 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Syne2Q6ZWQ0 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Syne2Q6ZWQ0 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Syne2Q6ZWQ0 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Syne2Q6ZWQ0 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.38□□□□□ -0.91
Syne2Q6ZWQ0 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Syne2Q6ZWQ0 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Syne2Q6ZWQ0 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Syne2Q6ZWQ0 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Syne2Q6ZWQ0 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Syne2Q6ZWQ0 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC9.38□□□□□ -0.91
Syne2Q6ZWQ0 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.38□□□□□ -0.91
Syne2Q6ZWQ0 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.38□□□□□ -0.91
Syne2Q6ZWQ0 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC9.37□□□□□ -0.91
Syne2Q6ZWQ0 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Syne2Q6ZWQ0 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Syne2Q6ZWQ0 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
Syne2Q6ZWQ0 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Syne2Q6ZWQ0 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Syne2Q6ZWQ0 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Syne2Q6ZWQ0 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Syne2Q6ZWQ0 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC9.37□□□□□ -0.91
Syne2Q6ZWQ0 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC9.37□□□□□ -0.91
Syne2Q6ZWQ0 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Syne2Q6ZWQ0 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Syne2Q6ZWQ0 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
Syne2Q6ZWQ0 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Syne2Q6ZWQ0 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Syne2Q6ZWQ0 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
Syne2Q6ZWQ0 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Syne2Q6ZWQ0 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Syne2Q6ZWQ0 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Syne2Q6ZWQ0 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Syne2Q6ZWQ0 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
Syne2Q6ZWQ0 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
Syne2Q6ZWQ0 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Syne2Q6ZWQ0 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Syne2Q6ZWQ0 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Syne2Q6ZWQ0 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Syne2Q6ZWQ0 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Syne2Q6ZWQ0 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
Syne2Q6ZWQ0 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Syne2Q6ZWQ0 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Syne2Q6ZWQ0 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Syne2Q6ZWQ0 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Syne2Q6ZWQ0 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Syne2Q6ZWQ0 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Syne2Q6ZWQ0 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Syne2Q6ZWQ0 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Syne2Q6ZWQ0 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Syne2Q6ZWQ0 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Syne2Q6ZWQ0 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Syne2Q6ZWQ0 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Syne2Q6ZWQ0 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
Syne2Q6ZWQ0 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Syne2Q6ZWQ0 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Syne2Q6ZWQ0 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Syne2Q6ZWQ0 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Syne2Q6ZWQ0 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms