Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ93

Usp34, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 34, mousemouse

Predictions only

Length 3,582 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp34Q6ZQ93 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Usp34Q6ZQ93 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Usp34Q6ZQ93 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Usp34Q6ZQ93 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Usp34Q6ZQ93 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Usp34Q6ZQ93 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Usp34Q6ZQ93 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Usp34Q6ZQ93 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Usp34Q6ZQ93 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Usp34Q6ZQ93 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Usp34Q6ZQ93 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Usp34Q6ZQ93 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Usp34Q6ZQ93 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Usp34Q6ZQ93 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Usp34Q6ZQ93 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Usp34Q6ZQ93 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Usp34Q6ZQ93 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Usp34Q6ZQ93 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Usp34Q6ZQ93 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Usp34Q6ZQ93 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Usp34Q6ZQ93 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Usp34Q6ZQ93 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Usp34Q6ZQ93 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Usp34Q6ZQ93 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Usp34Q6ZQ93 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Usp34Q6ZQ93 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Usp34Q6ZQ93 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Usp34Q6ZQ93 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Usp34Q6ZQ93 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Usp34Q6ZQ93 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Usp34Q6ZQ93 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Usp34Q6ZQ93 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Usp34Q6ZQ93 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Usp34Q6ZQ93 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Usp34Q6ZQ93 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Usp34Q6ZQ93 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Usp34Q6ZQ93 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Usp34Q6ZQ93 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Usp34Q6ZQ93 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Usp34Q6ZQ93 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Usp34Q6ZQ93 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Usp34Q6ZQ93 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Usp34Q6ZQ93 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Usp34Q6ZQ93 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Usp34Q6ZQ93 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Usp34Q6ZQ93 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Usp34Q6ZQ93 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Usp34Q6ZQ93 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Usp34Q6ZQ93 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Usp34Q6ZQ93 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Usp34Q6ZQ93 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Usp34Q6ZQ93 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Usp34Q6ZQ93 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Usp34Q6ZQ93 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Usp34Q6ZQ93 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Usp34Q6ZQ93 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Usp34Q6ZQ93 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Usp34Q6ZQ93 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Usp34Q6ZQ93 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Usp34Q6ZQ93 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Usp34Q6ZQ93 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Usp34Q6ZQ93 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Usp34Q6ZQ93 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Usp34Q6ZQ93 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Usp34Q6ZQ93 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Usp34Q6ZQ93 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Usp34Q6ZQ93 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Usp34Q6ZQ93 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Usp34Q6ZQ93 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Usp34Q6ZQ93 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Usp34Q6ZQ93 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Usp34Q6ZQ93 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Usp34Q6ZQ93 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Usp34Q6ZQ93 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Usp34Q6ZQ93 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Usp34Q6ZQ93 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Usp34Q6ZQ93 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Usp34Q6ZQ93 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Usp34Q6ZQ93 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Usp34Q6ZQ93 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Usp34Q6ZQ93 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Usp34Q6ZQ93 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Usp34Q6ZQ93 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Usp34Q6ZQ93 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Usp34Q6ZQ93 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Usp34Q6ZQ93 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Usp34Q6ZQ93 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Usp34Q6ZQ93 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Usp34Q6ZQ93 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Usp34Q6ZQ93 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Usp34Q6ZQ93 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Usp34Q6ZQ93 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Usp34Q6ZQ93 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Usp34Q6ZQ93 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Usp34Q6ZQ93 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Usp34Q6ZQ93 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Usp34Q6ZQ93 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Usp34Q6ZQ93 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Usp34Q6ZQ93 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Usp34Q6ZQ93 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.5 ms