Protein–RNA interactions for Protein: Q6P3E7

Hdac10, Histone deacetylase 10, mousemouse

Predictions only

Length 666 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac10Q6P3E7 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Hdac10Q6P3E7 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Hdac10Q6P3E7 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Hdac10Q6P3E7 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Hdac10Q6P3E7 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Hdac10Q6P3E7 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Hdac10Q6P3E7 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Hdac10Q6P3E7 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Hdac10Q6P3E7 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Hdac10Q6P3E7 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Hdac10Q6P3E7 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Hdac10Q6P3E7 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Hdac10Q6P3E7 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Hdac10Q6P3E7 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Hdac10Q6P3E7 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Hdac10Q6P3E7 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Hdac10Q6P3E7 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Hdac10Q6P3E7 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Hdac10Q6P3E7 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Hdac10Q6P3E7 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Hdac10Q6P3E7 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Hdac10Q6P3E7 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Hdac10Q6P3E7 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Hdac10Q6P3E7 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Hdac10Q6P3E7 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Hdac10Q6P3E7 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Hdac10Q6P3E7 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Hdac10Q6P3E7 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Hdac10Q6P3E7 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Hdac10Q6P3E7 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Hdac10Q6P3E7 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Hdac10Q6P3E7 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Hdac10Q6P3E7 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Hdac10Q6P3E7 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Hdac10Q6P3E7 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Hdac10Q6P3E7 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Hdac10Q6P3E7 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Hdac10Q6P3E7 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Hdac10Q6P3E7 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Hdac10Q6P3E7 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Hdac10Q6P3E7 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Hdac10Q6P3E7 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Hdac10Q6P3E7 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Hdac10Q6P3E7 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Hdac10Q6P3E7 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Hdac10Q6P3E7 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Hdac10Q6P3E7 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Hdac10Q6P3E7 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Hdac10Q6P3E7 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Hdac10Q6P3E7 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Hdac10Q6P3E7 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Hdac10Q6P3E7 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Hdac10Q6P3E7 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Hdac10Q6P3E7 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Hdac10Q6P3E7 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Hdac10Q6P3E7 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Hdac10Q6P3E7 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Hdac10Q6P3E7 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Hdac10Q6P3E7 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Hdac10Q6P3E7 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Hdac10Q6P3E7 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Hdac10Q6P3E7 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Hdac10Q6P3E7 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Hdac10Q6P3E7 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Hdac10Q6P3E7 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Hdac10Q6P3E7 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Hdac10Q6P3E7 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Hdac10Q6P3E7 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Hdac10Q6P3E7 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Hdac10Q6P3E7 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Hdac10Q6P3E7 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Hdac10Q6P3E7 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Hdac10Q6P3E7 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Hdac10Q6P3E7 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Hdac10Q6P3E7 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Hdac10Q6P3E7 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Hdac10Q6P3E7 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Hdac10Q6P3E7 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Hdac10Q6P3E7 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Hdac10Q6P3E7 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Hdac10Q6P3E7 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Hdac10Q6P3E7 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Hdac10Q6P3E7 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Hdac10Q6P3E7 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Hdac10Q6P3E7 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Hdac10Q6P3E7 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Hdac10Q6P3E7 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Hdac10Q6P3E7 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Hdac10Q6P3E7 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Hdac10Q6P3E7 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Hdac10Q6P3E7 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Hdac10Q6P3E7 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Hdac10Q6P3E7 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Hdac10Q6P3E7 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Hdac10Q6P3E7 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Hdac10Q6P3E7 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Hdac10Q6P3E7 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Hdac10Q6P3E7 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Hdac10Q6P3E7 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Hdac10Q6P3E7 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.7 ms