Protein–RNA interactions for Protein: Q6KCD5

Nipbl, Nipped-B-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,798 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NipblQ6KCD5 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NipblQ6KCD5 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NipblQ6KCD5 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NipblQ6KCD5 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NipblQ6KCD5 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NipblQ6KCD5 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NipblQ6KCD5 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NipblQ6KCD5 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NipblQ6KCD5 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NipblQ6KCD5 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NipblQ6KCD5 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NipblQ6KCD5 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
NipblQ6KCD5 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NipblQ6KCD5 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NipblQ6KCD5 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NipblQ6KCD5 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NipblQ6KCD5 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NipblQ6KCD5 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NipblQ6KCD5 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NipblQ6KCD5 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
NipblQ6KCD5 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
NipblQ6KCD5 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NipblQ6KCD5 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NipblQ6KCD5 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NipblQ6KCD5 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NipblQ6KCD5 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NipblQ6KCD5 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NipblQ6KCD5 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NipblQ6KCD5 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NipblQ6KCD5 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NipblQ6KCD5 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NipblQ6KCD5 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NipblQ6KCD5 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NipblQ6KCD5 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NipblQ6KCD5 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NipblQ6KCD5 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
NipblQ6KCD5 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NipblQ6KCD5 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NipblQ6KCD5 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NipblQ6KCD5 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NipblQ6KCD5 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NipblQ6KCD5 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NipblQ6KCD5 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NipblQ6KCD5 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NipblQ6KCD5 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NipblQ6KCD5 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NipblQ6KCD5 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NipblQ6KCD5 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NipblQ6KCD5 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
NipblQ6KCD5 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
NipblQ6KCD5 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.13
NipblQ6KCD5 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
NipblQ6KCD5 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NipblQ6KCD5 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NipblQ6KCD5 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NipblQ6KCD5 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NipblQ6KCD5 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NipblQ6KCD5 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NipblQ6KCD5 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NipblQ6KCD5 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NipblQ6KCD5 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NipblQ6KCD5 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NipblQ6KCD5 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NipblQ6KCD5 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NipblQ6KCD5 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NipblQ6KCD5 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NipblQ6KCD5 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NipblQ6KCD5 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NipblQ6KCD5 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NipblQ6KCD5 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
NipblQ6KCD5 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NipblQ6KCD5 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NipblQ6KCD5 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NipblQ6KCD5 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NipblQ6KCD5 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NipblQ6KCD5 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NipblQ6KCD5 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NipblQ6KCD5 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
NipblQ6KCD5 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NipblQ6KCD5 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
NipblQ6KCD5 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NipblQ6KCD5 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NipblQ6KCD5 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NipblQ6KCD5 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NipblQ6KCD5 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NipblQ6KCD5 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NipblQ6KCD5 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NipblQ6KCD5 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NipblQ6KCD5 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NipblQ6KCD5 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NipblQ6KCD5 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NipblQ6KCD5 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
NipblQ6KCD5 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NipblQ6KCD5 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NipblQ6KCD5 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NipblQ6KCD5 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NipblQ6KCD5 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NipblQ6KCD5 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NipblQ6KCD5 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NipblQ6KCD5 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 547 ms