Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZU6

Thsd7a, Thrombospondin type-1 domain-containing protein 7A, mousemouse

Predictions only

Length 1,645 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thsd7aQ69ZU6 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Thsd7aQ69ZU6 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Thsd7aQ69ZU6 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Thsd7aQ69ZU6 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Thsd7aQ69ZU6 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Thsd7aQ69ZU6 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Thsd7aQ69ZU6 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Thsd7aQ69ZU6 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Thsd7aQ69ZU6 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Thsd7aQ69ZU6 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Thsd7aQ69ZU6 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Thsd7aQ69ZU6 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Thsd7aQ69ZU6 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Thsd7aQ69ZU6 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Thsd7aQ69ZU6 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Thsd7aQ69ZU6 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Thsd7aQ69ZU6 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Thsd7aQ69ZU6 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Thsd7aQ69ZU6 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Thsd7aQ69ZU6 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Thsd7aQ69ZU6 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Thsd7aQ69ZU6 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Thsd7aQ69ZU6 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Thsd7aQ69ZU6 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Thsd7aQ69ZU6 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Thsd7aQ69ZU6 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Thsd7aQ69ZU6 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
Thsd7aQ69ZU6 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Thsd7aQ69ZU6 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Thsd7aQ69ZU6 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Thsd7aQ69ZU6 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Thsd7aQ69ZU6 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Thsd7aQ69ZU6 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Thsd7aQ69ZU6 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Thsd7aQ69ZU6 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Thsd7aQ69ZU6 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Thsd7aQ69ZU6 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Thsd7aQ69ZU6 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Thsd7aQ69ZU6 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Thsd7aQ69ZU6 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Thsd7aQ69ZU6 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Thsd7aQ69ZU6 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Thsd7aQ69ZU6 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Thsd7aQ69ZU6 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Thsd7aQ69ZU6 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
Thsd7aQ69ZU6 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Thsd7aQ69ZU6 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Thsd7aQ69ZU6 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Thsd7aQ69ZU6 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Thsd7aQ69ZU6 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Thsd7aQ69ZU6 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
Thsd7aQ69ZU6 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Thsd7aQ69ZU6 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Thsd7aQ69ZU6 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Thsd7aQ69ZU6 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Thsd7aQ69ZU6 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Thsd7aQ69ZU6 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Thsd7aQ69ZU6 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Thsd7aQ69ZU6 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Thsd7aQ69ZU6 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Thsd7aQ69ZU6 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Thsd7aQ69ZU6 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Thsd7aQ69ZU6 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Thsd7aQ69ZU6 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Thsd7aQ69ZU6 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Thsd7aQ69ZU6 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Thsd7aQ69ZU6 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Thsd7aQ69ZU6 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Thsd7aQ69ZU6 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Thsd7aQ69ZU6 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Thsd7aQ69ZU6 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Thsd7aQ69ZU6 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Thsd7aQ69ZU6 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Thsd7aQ69ZU6 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Thsd7aQ69ZU6 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Thsd7aQ69ZU6 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Thsd7aQ69ZU6 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Thsd7aQ69ZU6 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Thsd7aQ69ZU6 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Thsd7aQ69ZU6 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Thsd7aQ69ZU6 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Thsd7aQ69ZU6 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Thsd7aQ69ZU6 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Thsd7aQ69ZU6 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Thsd7aQ69ZU6 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Thsd7aQ69ZU6 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Thsd7aQ69ZU6 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
Thsd7aQ69ZU6 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
Thsd7aQ69ZU6 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
Thsd7aQ69ZU6 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Thsd7aQ69ZU6 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Thsd7aQ69ZU6 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Thsd7aQ69ZU6 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Thsd7aQ69ZU6 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Thsd7aQ69ZU6 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Thsd7aQ69ZU6 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Thsd7aQ69ZU6 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Thsd7aQ69ZU6 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Thsd7aQ69ZU6 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Thsd7aQ69ZU6 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms