Protein–RNA interactions for Protein: Q640Q5

Pan3, PAN2-PAN3 deadenylation complex subunit Pan3, mousemouse

Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pan3Q640Q5 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pan3Q640Q5 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pan3Q640Q5 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pan3Q640Q5 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pan3Q640Q5 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pan3Q640Q5 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pan3Q640Q5 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pan3Q640Q5 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pan3Q640Q5 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pan3Q640Q5 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pan3Q640Q5 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pan3Q640Q5 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pan3Q640Q5 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pan3Q640Q5 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pan3Q640Q5 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pan3Q640Q5 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pan3Q640Q5 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pan3Q640Q5 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pan3Q640Q5 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pan3Q640Q5 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pan3Q640Q5 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pan3Q640Q5 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pan3Q640Q5 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pan3Q640Q5 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pan3Q640Q5 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pan3Q640Q5 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Pan3Q640Q5 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pan3Q640Q5 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pan3Q640Q5 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pan3Q640Q5 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pan3Q640Q5 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pan3Q640Q5 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pan3Q640Q5 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pan3Q640Q5 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pan3Q640Q5 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pan3Q640Q5 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pan3Q640Q5 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pan3Q640Q5 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pan3Q640Q5 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pan3Q640Q5 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pan3Q640Q5 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pan3Q640Q5 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pan3Q640Q5 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pan3Q640Q5 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pan3Q640Q5 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pan3Q640Q5 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pan3Q640Q5 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pan3Q640Q5 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pan3Q640Q5 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pan3Q640Q5 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pan3Q640Q5 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pan3Q640Q5 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pan3Q640Q5 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pan3Q640Q5 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pan3Q640Q5 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pan3Q640Q5 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pan3Q640Q5 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pan3Q640Q5 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pan3Q640Q5 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pan3Q640Q5 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pan3Q640Q5 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pan3Q640Q5 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pan3Q640Q5 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pan3Q640Q5 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pan3Q640Q5 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pan3Q640Q5 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pan3Q640Q5 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pan3Q640Q5 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pan3Q640Q5 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pan3Q640Q5 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pan3Q640Q5 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pan3Q640Q5 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pan3Q640Q5 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Pan3Q640Q5 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pan3Q640Q5 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pan3Q640Q5 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Pan3Q640Q5 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Pan3Q640Q5 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Pan3Q640Q5 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Pan3Q640Q5 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Pan3Q640Q5 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Pan3Q640Q5 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Pan3Q640Q5 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Pan3Q640Q5 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Pan3Q640Q5 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Pan3Q640Q5 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Pan3Q640Q5 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Pan3Q640Q5 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Pan3Q640Q5 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Pan3Q640Q5 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Pan3Q640Q5 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Pan3Q640Q5 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Pan3Q640Q5 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Pan3Q640Q5 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Pan3Q640Q5 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Pan3Q640Q5 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Pan3Q640Q5 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Pan3Q640Q5 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Pan3Q640Q5 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Pan3Q640Q5 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms