Protein–RNA interactions for Protein: Q62472

Lcn4, Vomeronasal secretory protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lcn4Q62472 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Lcn4Q62472 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lcn4Q62472 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lcn4Q62472 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lcn4Q62472 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lcn4Q62472 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lcn4Q62472 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lcn4Q62472 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lcn4Q62472 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lcn4Q62472 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lcn4Q62472 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lcn4Q62472 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Lcn4Q62472 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Lcn4Q62472 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lcn4Q62472 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lcn4Q62472 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lcn4Q62472 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lcn4Q62472 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lcn4Q62472 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lcn4Q62472 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lcn4Q62472 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lcn4Q62472 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Lcn4Q62472 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lcn4Q62472 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lcn4Q62472 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lcn4Q62472 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lcn4Q62472 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lcn4Q62472 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lcn4Q62472 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lcn4Q62472 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lcn4Q62472 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Lcn4Q62472 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lcn4Q62472 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lcn4Q62472 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lcn4Q62472 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lcn4Q62472 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Lcn4Q62472 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lcn4Q62472 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lcn4Q62472 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lcn4Q62472 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lcn4Q62472 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lcn4Q62472 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lcn4Q62472 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lcn4Q62472 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lcn4Q62472 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lcn4Q62472 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Lcn4Q62472 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lcn4Q62472 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lcn4Q62472 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lcn4Q62472 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lcn4Q62472 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lcn4Q62472 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lcn4Q62472 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lcn4Q62472 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lcn4Q62472 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lcn4Q62472 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lcn4Q62472 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lcn4Q62472 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lcn4Q62472 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lcn4Q62472 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lcn4Q62472 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lcn4Q62472 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lcn4Q62472 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lcn4Q62472 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lcn4Q62472 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lcn4Q62472 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lcn4Q62472 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Lcn4Q62472 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lcn4Q62472 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lcn4Q62472 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lcn4Q62472 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lcn4Q62472 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lcn4Q62472 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lcn4Q62472 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lcn4Q62472 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lcn4Q62472 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lcn4Q62472 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lcn4Q62472 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lcn4Q62472 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lcn4Q62472 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lcn4Q62472 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lcn4Q62472 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lcn4Q62472 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lcn4Q62472 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lcn4Q62472 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lcn4Q62472 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lcn4Q62472 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lcn4Q62472 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lcn4Q62472 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lcn4Q62472 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lcn4Q62472 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lcn4Q62472 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Lcn4Q62472 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Lcn4Q62472 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Lcn4Q62472 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Lcn4Q62472 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Lcn4Q62472 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Lcn4Q62472 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Lcn4Q62472 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Lcn4Q62472 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms