Protein–RNA interactions for Protein: Q62186

Ssr4, Translocon-associated protein subunit delta, mousemouse

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Length 172 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssr4Q62186 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ssr4Q62186 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ssr4Q62186 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ssr4Q62186 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ssr4Q62186 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Ssr4Q62186 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ssr4Q62186 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ssr4Q62186 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Ssr4Q62186 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ssr4Q62186 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ssr4Q62186 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ssr4Q62186 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ssr4Q62186 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ssr4Q62186 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ssr4Q62186 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ssr4Q62186 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Ssr4Q62186 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ssr4Q62186 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ssr4Q62186 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Ssr4Q62186 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Ssr4Q62186 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Ssr4Q62186 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Ssr4Q62186 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ssr4Q62186 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ssr4Q62186 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ssr4Q62186 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ssr4Q62186 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ssr4Q62186 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ssr4Q62186 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ssr4Q62186 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ssr4Q62186 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ssr4Q62186 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ssr4Q62186 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ssr4Q62186 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Ssr4Q62186 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ssr4Q62186 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ssr4Q62186 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ssr4Q62186 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ssr4Q62186 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Ssr4Q62186 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ssr4Q62186 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ssr4Q62186 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Ssr4Q62186 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Ssr4Q62186 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ssr4Q62186 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ssr4Q62186 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ssr4Q62186 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ssr4Q62186 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ssr4Q62186 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Ssr4Q62186 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ssr4Q62186 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ssr4Q62186 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ssr4Q62186 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ssr4Q62186 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ssr4Q62186 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
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Ssr4Q62186 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
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Ssr4Q62186 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
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Ssr4Q62186 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ssr4Q62186 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ssr4Q62186 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
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Ssr4Q62186 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
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Ssr4Q62186 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ssr4Q62186 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ssr4Q62186 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Ssr4Q62186 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ssr4Q62186 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ssr4Q62186 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ssr4Q62186 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ssr4Q62186 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ssr4Q62186 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ssr4Q62186 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Ssr4Q62186 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ssr4Q62186 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ssr4Q62186 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ssr4Q62186 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ssr4Q62186 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ssr4Q62186 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ssr4Q62186 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ssr4Q62186 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ssr4Q62186 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ssr4Q62186 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ssr4Q62186 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ssr4Q62186 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ssr4Q62186 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ssr4Q62186 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ssr4Q62186 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
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