Protein–RNA interactions for Protein: Q61286

Tcf12, Transcription factor 12, mousemouse

Predictions only

Length 706 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcf12Q61286 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tcf12Q61286 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tcf12Q61286 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tcf12Q61286 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Tcf12Q61286 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tcf12Q61286 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tcf12Q61286 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tcf12Q61286 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tcf12Q61286 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tcf12Q61286 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Tcf12Q61286 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tcf12Q61286 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tcf12Q61286 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tcf12Q61286 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tcf12Q61286 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tcf12Q61286 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tcf12Q61286 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tcf12Q61286 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tcf12Q61286 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tcf12Q61286 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tcf12Q61286 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tcf12Q61286 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tcf12Q61286 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tcf12Q61286 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tcf12Q61286 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tcf12Q61286 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tcf12Q61286 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tcf12Q61286 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tcf12Q61286 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tcf12Q61286 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tcf12Q61286 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tcf12Q61286 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tcf12Q61286 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tcf12Q61286 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tcf12Q61286 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tcf12Q61286 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tcf12Q61286 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tcf12Q61286 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tcf12Q61286 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tcf12Q61286 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tcf12Q61286 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Tcf12Q61286 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tcf12Q61286 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tcf12Q61286 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tcf12Q61286 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tcf12Q61286 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tcf12Q61286 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tcf12Q61286 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Tcf12Q61286 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Tcf12Q61286 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tcf12Q61286 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tcf12Q61286 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tcf12Q61286 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tcf12Q61286 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tcf12Q61286 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tcf12Q61286 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tcf12Q61286 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Tcf12Q61286 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tcf12Q61286 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Tcf12Q61286 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tcf12Q61286 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tcf12Q61286 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tcf12Q61286 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tcf12Q61286 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tcf12Q61286 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tcf12Q61286 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Tcf12Q61286 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tcf12Q61286 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tcf12Q61286 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tcf12Q61286 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tcf12Q61286 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tcf12Q61286 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tcf12Q61286 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tcf12Q61286 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tcf12Q61286 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tcf12Q61286 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tcf12Q61286 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Tcf12Q61286 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tcf12Q61286 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tcf12Q61286 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tcf12Q61286 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Tcf12Q61286 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tcf12Q61286 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tcf12Q61286 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tcf12Q61286 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tcf12Q61286 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tcf12Q61286 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tcf12Q61286 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tcf12Q61286 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tcf12Q61286 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tcf12Q61286 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tcf12Q61286 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tcf12Q61286 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tcf12Q61286 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tcf12Q61286 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tcf12Q61286 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Tcf12Q61286 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tcf12Q61286 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tcf12Q61286 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tcf12Q61286 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms