Protein–RNA interactions for Protein: Q61136

Prpf4b, Serine/threonine-protein kinase PRP4 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,007 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf4bQ61136 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Prpf4bQ61136 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Prpf4bQ61136 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Prpf4bQ61136 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Prpf4bQ61136 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Prpf4bQ61136 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Prpf4bQ61136 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Prpf4bQ61136 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Prpf4bQ61136 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Prpf4bQ61136 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Prpf4bQ61136 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Prpf4bQ61136 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Prpf4bQ61136 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Prpf4bQ61136 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Prpf4bQ61136 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Prpf4bQ61136 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Prpf4bQ61136 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Prpf4bQ61136 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Prpf4bQ61136 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Prpf4bQ61136 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Prpf4bQ61136 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Prpf4bQ61136 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Prpf4bQ61136 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Prpf4bQ61136 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Prpf4bQ61136 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Prpf4bQ61136 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Prpf4bQ61136 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Prpf4bQ61136 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Prpf4bQ61136 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Prpf4bQ61136 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Prpf4bQ61136 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Prpf4bQ61136 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Prpf4bQ61136 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Prpf4bQ61136 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Prpf4bQ61136 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Prpf4bQ61136 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Prpf4bQ61136 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Prpf4bQ61136 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Prpf4bQ61136 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Prpf4bQ61136 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Prpf4bQ61136 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Prpf4bQ61136 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Prpf4bQ61136 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Prpf4bQ61136 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Prpf4bQ61136 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Prpf4bQ61136 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Prpf4bQ61136 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Prpf4bQ61136 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Prpf4bQ61136 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Prpf4bQ61136 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Prpf4bQ61136 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Prpf4bQ61136 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Prpf4bQ61136 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Prpf4bQ61136 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Prpf4bQ61136 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Prpf4bQ61136 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Prpf4bQ61136 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Prpf4bQ61136 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Prpf4bQ61136 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Prpf4bQ61136 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Prpf4bQ61136 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Prpf4bQ61136 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Prpf4bQ61136 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Prpf4bQ61136 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Prpf4bQ61136 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Prpf4bQ61136 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Prpf4bQ61136 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Prpf4bQ61136 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Prpf4bQ61136 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Prpf4bQ61136 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Prpf4bQ61136 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Prpf4bQ61136 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Prpf4bQ61136 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Prpf4bQ61136 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Prpf4bQ61136 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Prpf4bQ61136 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Prpf4bQ61136 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Prpf4bQ61136 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Prpf4bQ61136 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Prpf4bQ61136 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Prpf4bQ61136 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Prpf4bQ61136 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Prpf4bQ61136 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Prpf4bQ61136 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Prpf4bQ61136 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Prpf4bQ61136 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Prpf4bQ61136 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Prpf4bQ61136 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Prpf4bQ61136 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Prpf4bQ61136 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Prpf4bQ61136 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Prpf4bQ61136 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Prpf4bQ61136 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Prpf4bQ61136 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Prpf4bQ61136 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Prpf4bQ61136 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Prpf4bQ61136 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Prpf4bQ61136 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Prpf4bQ61136 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Prpf4bQ61136 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms