Protein–RNA interactions for Protein: Q5SPL2

Phf12, PHD finger protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 1,003 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf12Q5SPL2 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Phf12Q5SPL2 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Phf12Q5SPL2 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Phf12Q5SPL2 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Phf12Q5SPL2 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Phf12Q5SPL2 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Phf12Q5SPL2 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Phf12Q5SPL2 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Phf12Q5SPL2 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Phf12Q5SPL2 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Phf12Q5SPL2 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Phf12Q5SPL2 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Phf12Q5SPL2 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Phf12Q5SPL2 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Phf12Q5SPL2 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Phf12Q5SPL2 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Phf12Q5SPL2 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Phf12Q5SPL2 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Phf12Q5SPL2 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Phf12Q5SPL2 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Phf12Q5SPL2 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Phf12Q5SPL2 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Phf12Q5SPL2 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Phf12Q5SPL2 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Phf12Q5SPL2 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Phf12Q5SPL2 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Phf12Q5SPL2 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Phf12Q5SPL2 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Phf12Q5SPL2 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Phf12Q5SPL2 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Phf12Q5SPL2 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Phf12Q5SPL2 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Phf12Q5SPL2 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Phf12Q5SPL2 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Phf12Q5SPL2 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Phf12Q5SPL2 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Phf12Q5SPL2 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Phf12Q5SPL2 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Phf12Q5SPL2 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Phf12Q5SPL2 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Phf12Q5SPL2 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Phf12Q5SPL2 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Phf12Q5SPL2 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Phf12Q5SPL2 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Phf12Q5SPL2 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Phf12Q5SPL2 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Phf12Q5SPL2 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Phf12Q5SPL2 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Phf12Q5SPL2 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Phf12Q5SPL2 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Phf12Q5SPL2 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Phf12Q5SPL2 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Phf12Q5SPL2 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Phf12Q5SPL2 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Phf12Q5SPL2 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Phf12Q5SPL2 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Phf12Q5SPL2 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Phf12Q5SPL2 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Phf12Q5SPL2 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Phf12Q5SPL2 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Phf12Q5SPL2 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Phf12Q5SPL2 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Phf12Q5SPL2 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Phf12Q5SPL2 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Phf12Q5SPL2 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Phf12Q5SPL2 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Phf12Q5SPL2 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Phf12Q5SPL2 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Phf12Q5SPL2 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Phf12Q5SPL2 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Phf12Q5SPL2 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Phf12Q5SPL2 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Phf12Q5SPL2 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Phf12Q5SPL2 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Phf12Q5SPL2 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Phf12Q5SPL2 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Phf12Q5SPL2 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Phf12Q5SPL2 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Phf12Q5SPL2 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Phf12Q5SPL2 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Phf12Q5SPL2 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Phf12Q5SPL2 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Phf12Q5SPL2 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Phf12Q5SPL2 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Phf12Q5SPL2 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Phf12Q5SPL2 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Phf12Q5SPL2 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Phf12Q5SPL2 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Phf12Q5SPL2 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Phf12Q5SPL2 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Phf12Q5SPL2 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Phf12Q5SPL2 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Phf12Q5SPL2 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Phf12Q5SPL2 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Phf12Q5SPL2 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Phf12Q5SPL2 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Phf12Q5SPL2 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Phf12Q5SPL2 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Phf12Q5SPL2 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Phf12Q5SPL2 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms