Protein–RNA interactions for Protein: Q5HZG4

Taf3, Transcription initiation factor TFIID subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 932 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf3Q5HZG4 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Taf3Q5HZG4 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Taf3Q5HZG4 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Taf3Q5HZG4 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Taf3Q5HZG4 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Taf3Q5HZG4 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Taf3Q5HZG4 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Taf3Q5HZG4 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Taf3Q5HZG4 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Taf3Q5HZG4 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Taf3Q5HZG4 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Taf3Q5HZG4 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Taf3Q5HZG4 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Taf3Q5HZG4 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Taf3Q5HZG4 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Taf3Q5HZG4 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Taf3Q5HZG4 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Taf3Q5HZG4 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Taf3Q5HZG4 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Taf3Q5HZG4 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Taf3Q5HZG4 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Taf3Q5HZG4 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Taf3Q5HZG4 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Taf3Q5HZG4 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Taf3Q5HZG4 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Taf3Q5HZG4 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Taf3Q5HZG4 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Taf3Q5HZG4 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Taf3Q5HZG4 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Taf3Q5HZG4 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Taf3Q5HZG4 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Taf3Q5HZG4 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Taf3Q5HZG4 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Taf3Q5HZG4 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Taf3Q5HZG4 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Taf3Q5HZG4 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Taf3Q5HZG4 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Taf3Q5HZG4 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Taf3Q5HZG4 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Taf3Q5HZG4 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Taf3Q5HZG4 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Taf3Q5HZG4 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Taf3Q5HZG4 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Taf3Q5HZG4 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Taf3Q5HZG4 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Taf3Q5HZG4 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Taf3Q5HZG4 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Taf3Q5HZG4 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Taf3Q5HZG4 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Taf3Q5HZG4 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Taf3Q5HZG4 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Taf3Q5HZG4 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Taf3Q5HZG4 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Taf3Q5HZG4 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Taf3Q5HZG4 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Taf3Q5HZG4 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Taf3Q5HZG4 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Taf3Q5HZG4 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Taf3Q5HZG4 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Taf3Q5HZG4 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Taf3Q5HZG4 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Taf3Q5HZG4 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Taf3Q5HZG4 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Taf3Q5HZG4 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Taf3Q5HZG4 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Taf3Q5HZG4 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Taf3Q5HZG4 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Taf3Q5HZG4 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Taf3Q5HZG4 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Taf3Q5HZG4 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Taf3Q5HZG4 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Taf3Q5HZG4 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Taf3Q5HZG4 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Taf3Q5HZG4 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Taf3Q5HZG4 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Taf3Q5HZG4 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Taf3Q5HZG4 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Taf3Q5HZG4 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Taf3Q5HZG4 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Taf3Q5HZG4 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Taf3Q5HZG4 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Taf3Q5HZG4 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Taf3Q5HZG4 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Taf3Q5HZG4 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Taf3Q5HZG4 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Taf3Q5HZG4 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Taf3Q5HZG4 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Taf3Q5HZG4 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Taf3Q5HZG4 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Taf3Q5HZG4 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Taf3Q5HZG4 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Taf3Q5HZG4 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Taf3Q5HZG4 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Taf3Q5HZG4 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Taf3Q5HZG4 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Taf3Q5HZG4 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Taf3Q5HZG4 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Taf3Q5HZG4 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Taf3Q5HZG4 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Taf3Q5HZG4 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.2 ms