Protein–RNA interactions for Protein: Q59J78

Ndufaf2, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex assembly factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufaf2Q59J78 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ndufaf2Q59J78 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Ndufaf2Q59J78 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ndufaf2Q59J78 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ndufaf2Q59J78 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ndufaf2Q59J78 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ndufaf2Q59J78 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ndufaf2Q59J78 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ndufaf2Q59J78 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Ndufaf2Q59J78 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Ndufaf2Q59J78 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Ndufaf2Q59J78 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Ndufaf2Q59J78 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Ndufaf2Q59J78 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ndufaf2Q59J78 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ndufaf2Q59J78 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.3■■□□□ 1
Ndufaf2Q59J78 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ndufaf2Q59J78 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Ndufaf2Q59J78 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Ndufaf2Q59J78 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Ndufaf2Q59J78 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Ndufaf2Q59J78 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ndufaf2Q59J78 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ndufaf2Q59J78 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Ndufaf2Q59J78 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ndufaf2Q59J78 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ndufaf2Q59J78 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ndufaf2Q59J78 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Ndufaf2Q59J78 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ndufaf2Q59J78 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ndufaf2Q59J78 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Ndufaf2Q59J78 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ndufaf2Q59J78 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ndufaf2Q59J78 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Ndufaf2Q59J78 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ndufaf2Q59J78 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ndufaf2Q59J78 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ndufaf2Q59J78 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ndufaf2Q59J78 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ndufaf2Q59J78 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ndufaf2Q59J78 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ndufaf2Q59J78 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ndufaf2Q59J78 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Ndufaf2Q59J78 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Ndufaf2Q59J78 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ndufaf2Q59J78 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ndufaf2Q59J78 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ndufaf2Q59J78 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ndufaf2Q59J78 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ndufaf2Q59J78 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ndufaf2Q59J78 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ndufaf2Q59J78 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ndufaf2Q59J78 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Ndufaf2Q59J78 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ndufaf2Q59J78 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ndufaf2Q59J78 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ndufaf2Q59J78 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ndufaf2Q59J78 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ndufaf2Q59J78 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ndufaf2Q59J78 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ndufaf2Q59J78 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ndufaf2Q59J78 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Ndufaf2Q59J78 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ndufaf2Q59J78 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ndufaf2Q59J78 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ndufaf2Q59J78 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ndufaf2Q59J78 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ndufaf2Q59J78 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ndufaf2Q59J78 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ndufaf2Q59J78 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ndufaf2Q59J78 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ndufaf2Q59J78 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ndufaf2Q59J78 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ndufaf2Q59J78 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ndufaf2Q59J78 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ndufaf2Q59J78 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ndufaf2Q59J78 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Ndufaf2Q59J78 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Ndufaf2Q59J78 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ndufaf2Q59J78 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ndufaf2Q59J78 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ndufaf2Q59J78 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ndufaf2Q59J78 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ndufaf2Q59J78 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ndufaf2Q59J78 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ndufaf2Q59J78 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ndufaf2Q59J78 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ndufaf2Q59J78 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ndufaf2Q59J78 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ndufaf2Q59J78 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ndufaf2Q59J78 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ndufaf2Q59J78 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ndufaf2Q59J78 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ndufaf2Q59J78 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ndufaf2Q59J78 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ndufaf2Q59J78 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ndufaf2Q59J78 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ndufaf2Q59J78 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ndufaf2Q59J78 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ndufaf2Q59J78 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms