Protein–RNA interactions for Protein: Q3V1H9

Samd5, Sterile alpha motif domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd5Q3V1H9 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Samd5Q3V1H9 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Samd5Q3V1H9 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Samd5Q3V1H9 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Samd5Q3V1H9 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Samd5Q3V1H9 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Samd5Q3V1H9 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Samd5Q3V1H9 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Samd5Q3V1H9 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Samd5Q3V1H9 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Samd5Q3V1H9 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Samd5Q3V1H9 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Samd5Q3V1H9 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Samd5Q3V1H9 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Samd5Q3V1H9 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Samd5Q3V1H9 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Samd5Q3V1H9 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Samd5Q3V1H9 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Samd5Q3V1H9 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Samd5Q3V1H9 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Samd5Q3V1H9 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Samd5Q3V1H9 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Samd5Q3V1H9 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Samd5Q3V1H9 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Samd5Q3V1H9 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Samd5Q3V1H9 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Samd5Q3V1H9 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Samd5Q3V1H9 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Samd5Q3V1H9 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Samd5Q3V1H9 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Samd5Q3V1H9 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Samd5Q3V1H9 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Samd5Q3V1H9 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Samd5Q3V1H9 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Samd5Q3V1H9 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Samd5Q3V1H9 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Samd5Q3V1H9 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Samd5Q3V1H9 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Samd5Q3V1H9 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Samd5Q3V1H9 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Samd5Q3V1H9 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Samd5Q3V1H9 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Samd5Q3V1H9 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Samd5Q3V1H9 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Samd5Q3V1H9 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Samd5Q3V1H9 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Samd5Q3V1H9 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Samd5Q3V1H9 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Samd5Q3V1H9 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Samd5Q3V1H9 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Samd5Q3V1H9 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Samd5Q3V1H9 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Samd5Q3V1H9 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Samd5Q3V1H9 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Samd5Q3V1H9 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Samd5Q3V1H9 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Samd5Q3V1H9 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Samd5Q3V1H9 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Samd5Q3V1H9 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Samd5Q3V1H9 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Samd5Q3V1H9 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Samd5Q3V1H9 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Samd5Q3V1H9 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Samd5Q3V1H9 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Samd5Q3V1H9 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Samd5Q3V1H9 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Samd5Q3V1H9 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Samd5Q3V1H9 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Samd5Q3V1H9 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Samd5Q3V1H9 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Samd5Q3V1H9 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Samd5Q3V1H9 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Samd5Q3V1H9 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Samd5Q3V1H9 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Samd5Q3V1H9 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Samd5Q3V1H9 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Samd5Q3V1H9 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Samd5Q3V1H9 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Samd5Q3V1H9 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Samd5Q3V1H9 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Samd5Q3V1H9 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Samd5Q3V1H9 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Samd5Q3V1H9 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Samd5Q3V1H9 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Samd5Q3V1H9 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Samd5Q3V1H9 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Samd5Q3V1H9 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Samd5Q3V1H9 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Samd5Q3V1H9 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Samd5Q3V1H9 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Samd5Q3V1H9 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Samd5Q3V1H9 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Samd5Q3V1H9 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Samd5Q3V1H9 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Samd5Q3V1H9 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Samd5Q3V1H9 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Samd5Q3V1H9 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Samd5Q3V1H9 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Samd5Q3V1H9 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Samd5Q3V1H9 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms