Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0U0

1700057G04Rik, Phospholipid scramblase, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700057G04RikQ3V0U0 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
1700057G04RikQ3V0U0 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
1700057G04RikQ3V0U0 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
1700057G04RikQ3V0U0 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
1700057G04RikQ3V0U0 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
1700057G04RikQ3V0U0 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
1700057G04RikQ3V0U0 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
1700057G04RikQ3V0U0 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
1700057G04RikQ3V0U0 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
1700057G04RikQ3V0U0 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
1700057G04RikQ3V0U0 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
1700057G04RikQ3V0U0 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
1700057G04RikQ3V0U0 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
1700057G04RikQ3V0U0 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
1700057G04RikQ3V0U0 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
1700057G04RikQ3V0U0 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
1700057G04RikQ3V0U0 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
1700057G04RikQ3V0U0 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
1700057G04RikQ3V0U0 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
1700057G04RikQ3V0U0 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
1700057G04RikQ3V0U0 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
1700057G04RikQ3V0U0 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
1700057G04RikQ3V0U0 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
1700057G04RikQ3V0U0 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
1700057G04RikQ3V0U0 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
1700057G04RikQ3V0U0 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
1700057G04RikQ3V0U0 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
1700057G04RikQ3V0U0 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
1700057G04RikQ3V0U0 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
1700057G04RikQ3V0U0 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
1700057G04RikQ3V0U0 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
1700057G04RikQ3V0U0 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
1700057G04RikQ3V0U0 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
1700057G04RikQ3V0U0 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
1700057G04RikQ3V0U0 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
1700057G04RikQ3V0U0 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
1700057G04RikQ3V0U0 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
1700057G04RikQ3V0U0 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
1700057G04RikQ3V0U0 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
1700057G04RikQ3V0U0 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
1700057G04RikQ3V0U0 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
1700057G04RikQ3V0U0 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
1700057G04RikQ3V0U0 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
1700057G04RikQ3V0U0 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
1700057G04RikQ3V0U0 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
1700057G04RikQ3V0U0 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
1700057G04RikQ3V0U0 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
1700057G04RikQ3V0U0 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
1700057G04RikQ3V0U0 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
1700057G04RikQ3V0U0 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
1700057G04RikQ3V0U0 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
1700057G04RikQ3V0U0 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
1700057G04RikQ3V0U0 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
1700057G04RikQ3V0U0 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
1700057G04RikQ3V0U0 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
1700057G04RikQ3V0U0 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
1700057G04RikQ3V0U0 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
1700057G04RikQ3V0U0 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
1700057G04RikQ3V0U0 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
1700057G04RikQ3V0U0 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
1700057G04RikQ3V0U0 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
1700057G04RikQ3V0U0 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
1700057G04RikQ3V0U0 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
1700057G04RikQ3V0U0 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
1700057G04RikQ3V0U0 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
1700057G04RikQ3V0U0 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
1700057G04RikQ3V0U0 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
1700057G04RikQ3V0U0 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
1700057G04RikQ3V0U0 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
1700057G04RikQ3V0U0 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
1700057G04RikQ3V0U0 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
1700057G04RikQ3V0U0 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
1700057G04RikQ3V0U0 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
1700057G04RikQ3V0U0 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
1700057G04RikQ3V0U0 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
1700057G04RikQ3V0U0 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
1700057G04RikQ3V0U0 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
1700057G04RikQ3V0U0 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
1700057G04RikQ3V0U0 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
1700057G04RikQ3V0U0 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
1700057G04RikQ3V0U0 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
1700057G04RikQ3V0U0 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
1700057G04RikQ3V0U0 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
1700057G04RikQ3V0U0 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
1700057G04RikQ3V0U0 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
1700057G04RikQ3V0U0 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
1700057G04RikQ3V0U0 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
1700057G04RikQ3V0U0 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
1700057G04RikQ3V0U0 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
1700057G04RikQ3V0U0 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
1700057G04RikQ3V0U0 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
1700057G04RikQ3V0U0 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
1700057G04RikQ3V0U0 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
1700057G04RikQ3V0U0 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
1700057G04RikQ3V0U0 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
1700057G04RikQ3V0U0 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
1700057G04RikQ3V0U0 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
1700057G04RikQ3V0U0 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
1700057G04RikQ3V0U0 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
1700057G04RikQ3V0U0 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms