Protein–RNA interactions for Protein: Q3UU67

Trat1, T-cell receptor-associated transmembrane adapter 1, mousemouse

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trat1Q3UU67 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trat1Q3UU67 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Trat1Q3UU67 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trat1Q3UU67 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trat1Q3UU67 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Trat1Q3UU67 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trat1Q3UU67 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trat1Q3UU67 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trat1Q3UU67 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trat1Q3UU67 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trat1Q3UU67 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trat1Q3UU67 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trat1Q3UU67 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trat1Q3UU67 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trat1Q3UU67 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trat1Q3UU67 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trat1Q3UU67 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trat1Q3UU67 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trat1Q3UU67 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trat1Q3UU67 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trat1Q3UU67 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trat1Q3UU67 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trat1Q3UU67 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trat1Q3UU67 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trat1Q3UU67 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trat1Q3UU67 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Trat1Q3UU67 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trat1Q3UU67 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trat1Q3UU67 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trat1Q3UU67 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trat1Q3UU67 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trat1Q3UU67 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trat1Q3UU67 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trat1Q3UU67 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trat1Q3UU67 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trat1Q3UU67 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trat1Q3UU67 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trat1Q3UU67 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trat1Q3UU67 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trat1Q3UU67 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trat1Q3UU67 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trat1Q3UU67 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trat1Q3UU67 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trat1Q3UU67 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trat1Q3UU67 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trat1Q3UU67 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trat1Q3UU67 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trat1Q3UU67 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trat1Q3UU67 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trat1Q3UU67 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trat1Q3UU67 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trat1Q3UU67 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trat1Q3UU67 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trat1Q3UU67 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trat1Q3UU67 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trat1Q3UU67 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trat1Q3UU67 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trat1Q3UU67 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trat1Q3UU67 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trat1Q3UU67 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trat1Q3UU67 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trat1Q3UU67 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trat1Q3UU67 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trat1Q3UU67 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trat1Q3UU67 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trat1Q3UU67 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trat1Q3UU67 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trat1Q3UU67 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trat1Q3UU67 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trat1Q3UU67 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trat1Q3UU67 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trat1Q3UU67 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trat1Q3UU67 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trat1Q3UU67 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trat1Q3UU67 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trat1Q3UU67 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trat1Q3UU67 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trat1Q3UU67 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trat1Q3UU67 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trat1Q3UU67 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trat1Q3UU67 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trat1Q3UU67 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trat1Q3UU67 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trat1Q3UU67 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trat1Q3UU67 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trat1Q3UU67 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trat1Q3UU67 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trat1Q3UU67 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trat1Q3UU67 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trat1Q3UU67 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trat1Q3UU67 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trat1Q3UU67 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trat1Q3UU67 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trat1Q3UU67 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Trat1Q3UU67 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Trat1Q3UU67 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trat1Q3UU67 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trat1Q3UU67 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trat1Q3UU67 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trat1Q3UU67 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms