Protein–RNA interactions for Protein: Q3UH06

Rreb1, Ras-responsive element-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,700 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rreb1Q3UH06 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Rreb1Q3UH06 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Rreb1Q3UH06 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Rreb1Q3UH06 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Rreb1Q3UH06 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Rreb1Q3UH06 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Rreb1Q3UH06 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Rreb1Q3UH06 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Rreb1Q3UH06 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Rreb1Q3UH06 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Rreb1Q3UH06 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Rreb1Q3UH06 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Rreb1Q3UH06 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Rreb1Q3UH06 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Rreb1Q3UH06 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Rreb1Q3UH06 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Rreb1Q3UH06 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Rreb1Q3UH06 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Rreb1Q3UH06 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Rreb1Q3UH06 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Rreb1Q3UH06 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Rreb1Q3UH06 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Rreb1Q3UH06 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
Rreb1Q3UH06 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Rreb1Q3UH06 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Rreb1Q3UH06 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC28.2■■■□□ 2.11
Rreb1Q3UH06 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
Rreb1Q3UH06 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Rreb1Q3UH06 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Rreb1Q3UH06 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Rreb1Q3UH06 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Rreb1Q3UH06 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Rreb1Q3UH06 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Rreb1Q3UH06 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Rreb1Q3UH06 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Rreb1Q3UH06 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
Rreb1Q3UH06 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Rreb1Q3UH06 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Rreb1Q3UH06 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Rreb1Q3UH06 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
Rreb1Q3UH06 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Rreb1Q3UH06 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
Rreb1Q3UH06 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
Rreb1Q3UH06 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Rreb1Q3UH06 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Rreb1Q3UH06 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Rreb1Q3UH06 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Rreb1Q3UH06 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Rreb1Q3UH06 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Rreb1Q3UH06 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Rreb1Q3UH06 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Rreb1Q3UH06 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Rreb1Q3UH06 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Rreb1Q3UH06 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Rreb1Q3UH06 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Rreb1Q3UH06 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Rreb1Q3UH06 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Rreb1Q3UH06 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Rreb1Q3UH06 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Rreb1Q3UH06 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Rreb1Q3UH06 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Rreb1Q3UH06 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Rreb1Q3UH06 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Rreb1Q3UH06 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Rreb1Q3UH06 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Rreb1Q3UH06 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Rreb1Q3UH06 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Rreb1Q3UH06 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Rreb1Q3UH06 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Rreb1Q3UH06 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
Rreb1Q3UH06 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Rreb1Q3UH06 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Rreb1Q3UH06 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Rreb1Q3UH06 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Rreb1Q3UH06 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Rreb1Q3UH06 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Rreb1Q3UH06 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Rreb1Q3UH06 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Rreb1Q3UH06 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Rreb1Q3UH06 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
Rreb1Q3UH06 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Rreb1Q3UH06 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Rreb1Q3UH06 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Rreb1Q3UH06 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Rreb1Q3UH06 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Rreb1Q3UH06 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Rreb1Q3UH06 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Rreb1Q3UH06 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Rreb1Q3UH06 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Rreb1Q3UH06 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Rreb1Q3UH06 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Rreb1Q3UH06 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Rreb1Q3UH06 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Rreb1Q3UH06 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Rreb1Q3UH06 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Rreb1Q3UH06 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Rreb1Q3UH06 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Rreb1Q3UH06 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Rreb1Q3UH06 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Rreb1Q3UH06 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms