Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0P1

Palb2, Partner and localizer of BRCA2, mousemouse

Predictions only

Length 1,104 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Palb2Q3U0P1 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Palb2Q3U0P1 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Palb2Q3U0P1 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Palb2Q3U0P1 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Palb2Q3U0P1 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Palb2Q3U0P1 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Palb2Q3U0P1 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Palb2Q3U0P1 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Palb2Q3U0P1 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Palb2Q3U0P1 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Palb2Q3U0P1 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Palb2Q3U0P1 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Palb2Q3U0P1 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Palb2Q3U0P1 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Palb2Q3U0P1 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Palb2Q3U0P1 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Palb2Q3U0P1 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Palb2Q3U0P1 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Palb2Q3U0P1 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Palb2Q3U0P1 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Palb2Q3U0P1 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Palb2Q3U0P1 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Palb2Q3U0P1 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Palb2Q3U0P1 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Palb2Q3U0P1 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Palb2Q3U0P1 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Palb2Q3U0P1 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Palb2Q3U0P1 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Palb2Q3U0P1 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Palb2Q3U0P1 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Palb2Q3U0P1 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Palb2Q3U0P1 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Palb2Q3U0P1 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Palb2Q3U0P1 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Palb2Q3U0P1 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Palb2Q3U0P1 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Palb2Q3U0P1 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Palb2Q3U0P1 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Palb2Q3U0P1 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Palb2Q3U0P1 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Palb2Q3U0P1 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Palb2Q3U0P1 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Palb2Q3U0P1 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Palb2Q3U0P1 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Palb2Q3U0P1 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Palb2Q3U0P1 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Palb2Q3U0P1 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Palb2Q3U0P1 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Palb2Q3U0P1 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Palb2Q3U0P1 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Palb2Q3U0P1 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Palb2Q3U0P1 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Palb2Q3U0P1 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Palb2Q3U0P1 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Palb2Q3U0P1 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Palb2Q3U0P1 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Palb2Q3U0P1 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Palb2Q3U0P1 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Palb2Q3U0P1 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Palb2Q3U0P1 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Palb2Q3U0P1 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Palb2Q3U0P1 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Palb2Q3U0P1 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Palb2Q3U0P1 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Palb2Q3U0P1 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Palb2Q3U0P1 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Palb2Q3U0P1 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Palb2Q3U0P1 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Palb2Q3U0P1 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Palb2Q3U0P1 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Palb2Q3U0P1 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Palb2Q3U0P1 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Palb2Q3U0P1 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Palb2Q3U0P1 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Palb2Q3U0P1 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Palb2Q3U0P1 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Palb2Q3U0P1 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Palb2Q3U0P1 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Palb2Q3U0P1 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Palb2Q3U0P1 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Palb2Q3U0P1 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Palb2Q3U0P1 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Palb2Q3U0P1 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Palb2Q3U0P1 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Palb2Q3U0P1 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Palb2Q3U0P1 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Palb2Q3U0P1 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Palb2Q3U0P1 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Palb2Q3U0P1 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Palb2Q3U0P1 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Palb2Q3U0P1 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Palb2Q3U0P1 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Palb2Q3U0P1 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Palb2Q3U0P1 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Palb2Q3U0P1 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Palb2Q3U0P1 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Palb2Q3U0P1 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Palb2Q3U0P1 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Palb2Q3U0P1 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Palb2Q3U0P1 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms