Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVC7

Ccndbp1, Cyclin-D1-binding protein 1, mousemouse

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Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccndbp1Q3TVC7 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccndbp1Q3TVC7 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccndbp1Q3TVC7 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccndbp1Q3TVC7 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccndbp1Q3TVC7 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccndbp1Q3TVC7 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccndbp1Q3TVC7 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccndbp1Q3TVC7 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccndbp1Q3TVC7 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccndbp1Q3TVC7 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccndbp1Q3TVC7 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccndbp1Q3TVC7 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccndbp1Q3TVC7 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccndbp1Q3TVC7 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccndbp1Q3TVC7 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccndbp1Q3TVC7 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccndbp1Q3TVC7 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccndbp1Q3TVC7 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccndbp1Q3TVC7 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccndbp1Q3TVC7 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccndbp1Q3TVC7 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccndbp1Q3TVC7 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccndbp1Q3TVC7 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccndbp1Q3TVC7 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccndbp1Q3TVC7 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccndbp1Q3TVC7 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccndbp1Q3TVC7 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccndbp1Q3TVC7 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccndbp1Q3TVC7 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccndbp1Q3TVC7 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccndbp1Q3TVC7 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccndbp1Q3TVC7 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccndbp1Q3TVC7 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccndbp1Q3TVC7 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccndbp1Q3TVC7 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccndbp1Q3TVC7 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccndbp1Q3TVC7 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccndbp1Q3TVC7 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccndbp1Q3TVC7 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Ccndbp1Q3TVC7 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.99
Ccndbp1Q3TVC7 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Ccndbp1Q3TVC7 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccndbp1Q3TVC7 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccndbp1Q3TVC7 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccndbp1Q3TVC7 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccndbp1Q3TVC7 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccndbp1Q3TVC7 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccndbp1Q3TVC7 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccndbp1Q3TVC7 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccndbp1Q3TVC7 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccndbp1Q3TVC7 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccndbp1Q3TVC7 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccndbp1Q3TVC7 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccndbp1Q3TVC7 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccndbp1Q3TVC7 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccndbp1Q3TVC7 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccndbp1Q3TVC7 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccndbp1Q3TVC7 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccndbp1Q3TVC7 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccndbp1Q3TVC7 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccndbp1Q3TVC7 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccndbp1Q3TVC7 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccndbp1Q3TVC7 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccndbp1Q3TVC7 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccndbp1Q3TVC7 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccndbp1Q3TVC7 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccndbp1Q3TVC7 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccndbp1Q3TVC7 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccndbp1Q3TVC7 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccndbp1Q3TVC7 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccndbp1Q3TVC7 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccndbp1Q3TVC7 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccndbp1Q3TVC7 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccndbp1Q3TVC7 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccndbp1Q3TVC7 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccndbp1Q3TVC7 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccndbp1Q3TVC7 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccndbp1Q3TVC7 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccndbp1Q3TVC7 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccndbp1Q3TVC7 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccndbp1Q3TVC7 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccndbp1Q3TVC7 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccndbp1Q3TVC7 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccndbp1Q3TVC7 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccndbp1Q3TVC7 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccndbp1Q3TVC7 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccndbp1Q3TVC7 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccndbp1Q3TVC7 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccndbp1Q3TVC7 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccndbp1Q3TVC7 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccndbp1Q3TVC7 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccndbp1Q3TVC7 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccndbp1Q3TVC7 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccndbp1Q3TVC7 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccndbp1Q3TVC7 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccndbp1Q3TVC7 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccndbp1Q3TVC7 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccndbp1Q3TVC7 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccndbp1Q3TVC7 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ccndbp1Q3TVC7 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms