Protein–RNA interactions for Protein: Q3TKT4

Smarca4, Transcription activator BRG1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarca4Q3TKT4 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC36.56■■■■□ 3.44
Smarca4Q3TKT4 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
Smarca4Q3TKT4 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
Smarca4Q3TKT4 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
Smarca4Q3TKT4 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
Smarca4Q3TKT4 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
Smarca4Q3TKT4 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC36.55■■■■□ 3.44
Smarca4Q3TKT4 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.55■■■■□ 3.44
Smarca4Q3TKT4 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
Smarca4Q3TKT4 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
Smarca4Q3TKT4 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC36.53■■■■□ 3.44
Smarca4Q3TKT4 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
Smarca4Q3TKT4 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC36.53■■■■□ 3.44
Smarca4Q3TKT4 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC36.53■■■■□ 3.44
Smarca4Q3TKT4 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
Smarca4Q3TKT4 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
Smarca4Q3TKT4 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC36.52■■■■□ 3.44
Smarca4Q3TKT4 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
Smarca4Q3TKT4 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.44
Smarca4Q3TKT4 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.51■■■■□ 3.44
Smarca4Q3TKT4 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.43
Smarca4Q3TKT4 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
Smarca4Q3TKT4 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
Smarca4Q3TKT4 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC36.49■■■■□ 3.43
Smarca4Q3TKT4 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC36.49■■■■□ 3.43
Smarca4Q3TKT4 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
Smarca4Q3TKT4 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC36.48■■■■□ 3.43
Smarca4Q3TKT4 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
Smarca4Q3TKT4 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
Smarca4Q3TKT4 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.48■■■■□ 3.43
Smarca4Q3TKT4 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.48■■■■□ 3.43
Smarca4Q3TKT4 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
Smarca4Q3TKT4 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.47■■■■□ 3.43
Smarca4Q3TKT4 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
Smarca4Q3TKT4 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
Smarca4Q3TKT4 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
Smarca4Q3TKT4 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
Smarca4Q3TKT4 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
Smarca4Q3TKT4 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC36.45■■■■□ 3.43
Smarca4Q3TKT4 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
Smarca4Q3TKT4 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC36.44■■■■□ 3.42
Smarca4Q3TKT4 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
Smarca4Q3TKT4 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC36.44■■■■□ 3.42
Smarca4Q3TKT4 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
Smarca4Q3TKT4 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.43■■■■□ 3.42
Smarca4Q3TKT4 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC36.43■■■■□ 3.42
Smarca4Q3TKT4 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC36.43■■■■□ 3.42
Smarca4Q3TKT4 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
Smarca4Q3TKT4 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
Smarca4Q3TKT4 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
Smarca4Q3TKT4 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.42■■■■□ 3.42
Smarca4Q3TKT4 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC36.42■■■■□ 3.42
Smarca4Q3TKT4 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
Smarca4Q3TKT4 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
Smarca4Q3TKT4 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC36.41■■■■□ 3.42
Smarca4Q3TKT4 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
Smarca4Q3TKT4 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
Smarca4Q3TKT4 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
Smarca4Q3TKT4 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
Smarca4Q3TKT4 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC36.41■■■■□ 3.42
Smarca4Q3TKT4 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
Smarca4Q3TKT4 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
Smarca4Q3TKT4 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
Smarca4Q3TKT4 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC36.4■■■■□ 3.42
Smarca4Q3TKT4 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
Smarca4Q3TKT4 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
Smarca4Q3TKT4 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC36.39■■■■□ 3.42
Smarca4Q3TKT4 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
Smarca4Q3TKT4 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC36.39■■■■□ 3.42
Smarca4Q3TKT4 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
Smarca4Q3TKT4 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
Smarca4Q3TKT4 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC36.38■■■■□ 3.41
Smarca4Q3TKT4 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
Smarca4Q3TKT4 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
Smarca4Q3TKT4 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
Smarca4Q3TKT4 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC36.38■■■■□ 3.41
Smarca4Q3TKT4 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC36.37■■■■□ 3.41
Smarca4Q3TKT4 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
Smarca4Q3TKT4 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC36.37■■■■□ 3.41
Smarca4Q3TKT4 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
Smarca4Q3TKT4 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
Smarca4Q3TKT4 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
Smarca4Q3TKT4 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
Smarca4Q3TKT4 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
Smarca4Q3TKT4 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC36.36■■■■□ 3.41
Smarca4Q3TKT4 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC36.36■■■■□ 3.41
Smarca4Q3TKT4 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
Smarca4Q3TKT4 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
Smarca4Q3TKT4 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
Smarca4Q3TKT4 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
Smarca4Q3TKT4 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC36.35■■■■□ 3.41
Smarca4Q3TKT4 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.35■■■■□ 3.41
Smarca4Q3TKT4 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
Smarca4Q3TKT4 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
Smarca4Q3TKT4 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
Smarca4Q3TKT4 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.34■■■■□ 3.41
Smarca4Q3TKT4 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
Smarca4Q3TKT4 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
Smarca4Q3TKT4 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC36.34■■■■□ 3.41
Smarca4Q3TKT4 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms