Protein–RNA interactions for Protein: Q0VGT2

Gli2, Zinc finger protein GLI2, mousemouse

Predictions only

Length 1,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gli2Q0VGT2 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
Gli2Q0VGT2 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Gli2Q0VGT2 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Gli2Q0VGT2 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Gli2Q0VGT2 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
Gli2Q0VGT2 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC30.05■■■□□ 2.4
Gli2Q0VGT2 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Gli2Q0VGT2 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC30.05■■■□□ 2.4
Gli2Q0VGT2 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Gli2Q0VGT2 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
Gli2Q0VGT2 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
Gli2Q0VGT2 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
Gli2Q0VGT2 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Gli2Q0VGT2 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
Gli2Q0VGT2 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Gli2Q0VGT2 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
Gli2Q0VGT2 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
Gli2Q0VGT2 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Gli2Q0VGT2 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Gli2Q0VGT2 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Gli2Q0VGT2 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
Gli2Q0VGT2 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
Gli2Q0VGT2 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Gli2Q0VGT2 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Gli2Q0VGT2 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.4
Gli2Q0VGT2 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.4
Gli2Q0VGT2 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC30.01■■■□□ 2.4
Gli2Q0VGT2 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC30.01■■■□□ 2.39
Gli2Q0VGT2 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Gli2Q0VGT2 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Gli2Q0VGT2 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
Gli2Q0VGT2 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC30■■■□□ 2.39
Gli2Q0VGT2 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Gli2Q0VGT2 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Gli2Q0VGT2 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Gli2Q0VGT2 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
Gli2Q0VGT2 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Gli2Q0VGT2 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC29.98■■■□□ 2.39
Gli2Q0VGT2 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
Gli2Q0VGT2 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
Gli2Q0VGT2 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Gli2Q0VGT2 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Gli2Q0VGT2 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
Gli2Q0VGT2 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Gli2Q0VGT2 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Gli2Q0VGT2 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Gli2Q0VGT2 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Gli2Q0VGT2 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Gli2Q0VGT2 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Gli2Q0VGT2 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
Gli2Q0VGT2 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Gli2Q0VGT2 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Gli2Q0VGT2 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Gli2Q0VGT2 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
Gli2Q0VGT2 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC29.95■■■□□ 2.39
Gli2Q0VGT2 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
Gli2Q0VGT2 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.38
Gli2Q0VGT2 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
Gli2Q0VGT2 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
Gli2Q0VGT2 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
Gli2Q0VGT2 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC29.95■■■□□ 2.38
Gli2Q0VGT2 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.38
Gli2Q0VGT2 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
Gli2Q0VGT2 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
Gli2Q0VGT2 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Gli2Q0VGT2 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Gli2Q0VGT2 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Gli2Q0VGT2 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC29.94■■■□□ 2.38
Gli2Q0VGT2 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
Gli2Q0VGT2 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Gli2Q0VGT2 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Gli2Q0VGT2 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Gli2Q0VGT2 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Gli2Q0VGT2 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Gli2Q0VGT2 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
Gli2Q0VGT2 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC29.93■■■□□ 2.38
Gli2Q0VGT2 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Gli2Q0VGT2 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
Gli2Q0VGT2 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
Gli2Q0VGT2 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Gli2Q0VGT2 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
Gli2Q0VGT2 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Gli2Q0VGT2 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
Gli2Q0VGT2 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Gli2Q0VGT2 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Gli2Q0VGT2 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
Gli2Q0VGT2 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
Gli2Q0VGT2 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Gli2Q0VGT2 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Gli2Q0VGT2 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
Gli2Q0VGT2 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Gli2Q0VGT2 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Gli2Q0VGT2 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC29.88■■■□□ 2.37
Gli2Q0VGT2 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC29.88■■■□□ 2.37
Gli2Q0VGT2 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Gli2Q0VGT2 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Gli2Q0VGT2 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Gli2Q0VGT2 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
Gli2Q0VGT2 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Gli2Q0VGT2 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms