Protein–RNA interactions for Protein: Q06649

Sh3bp2, SH3 domain-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp2Q06649 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Sh3bp2Q06649 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sh3bp2Q06649 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sh3bp2Q06649 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sh3bp2Q06649 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sh3bp2Q06649 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sh3bp2Q06649 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sh3bp2Q06649 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sh3bp2Q06649 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Sh3bp2Q06649 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sh3bp2Q06649 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sh3bp2Q06649 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sh3bp2Q06649 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sh3bp2Q06649 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sh3bp2Q06649 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sh3bp2Q06649 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sh3bp2Q06649 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sh3bp2Q06649 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Sh3bp2Q06649 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sh3bp2Q06649 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Sh3bp2Q06649 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sh3bp2Q06649 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sh3bp2Q06649 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Sh3bp2Q06649 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sh3bp2Q06649 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sh3bp2Q06649 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sh3bp2Q06649 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sh3bp2Q06649 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sh3bp2Q06649 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sh3bp2Q06649 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sh3bp2Q06649 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sh3bp2Q06649 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sh3bp2Q06649 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sh3bp2Q06649 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sh3bp2Q06649 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sh3bp2Q06649 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sh3bp2Q06649 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sh3bp2Q06649 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sh3bp2Q06649 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Sh3bp2Q06649 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sh3bp2Q06649 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sh3bp2Q06649 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sh3bp2Q06649 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sh3bp2Q06649 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sh3bp2Q06649 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sh3bp2Q06649 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sh3bp2Q06649 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sh3bp2Q06649 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Sh3bp2Q06649 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Sh3bp2Q06649 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Sh3bp2Q06649 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Sh3bp2Q06649 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Sh3bp2Q06649 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Sh3bp2Q06649 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Sh3bp2Q06649 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sh3bp2Q06649 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sh3bp2Q06649 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sh3bp2Q06649 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sh3bp2Q06649 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sh3bp2Q06649 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Sh3bp2Q06649 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Sh3bp2Q06649 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sh3bp2Q06649 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sh3bp2Q06649 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sh3bp2Q06649 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Sh3bp2Q06649 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sh3bp2Q06649 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sh3bp2Q06649 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sh3bp2Q06649 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sh3bp2Q06649 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sh3bp2Q06649 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sh3bp2Q06649 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sh3bp2Q06649 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sh3bp2Q06649 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sh3bp2Q06649 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sh3bp2Q06649 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sh3bp2Q06649 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sh3bp2Q06649 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sh3bp2Q06649 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sh3bp2Q06649 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sh3bp2Q06649 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sh3bp2Q06649 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sh3bp2Q06649 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sh3bp2Q06649 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sh3bp2Q06649 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sh3bp2Q06649 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sh3bp2Q06649 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sh3bp2Q06649 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sh3bp2Q06649 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sh3bp2Q06649 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sh3bp2Q06649 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sh3bp2Q06649 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sh3bp2Q06649 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sh3bp2Q06649 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sh3bp2Q06649 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Sh3bp2Q06649 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Sh3bp2Q06649 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Sh3bp2Q06649 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Sh3bp2Q06649 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Sh3bp2Q06649 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms