Protein–RNA interactions for Protein: Q05A62

Dnal1, Dynein light chain 1, axonemal, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnal1Q05A62 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Dnal1Q05A62 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Dnal1Q05A62 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Dnal1Q05A62 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Dnal1Q05A62 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Dnal1Q05A62 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Dnal1Q05A62 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Dnal1Q05A62 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Dnal1Q05A62 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Dnal1Q05A62 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Dnal1Q05A62 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Dnal1Q05A62 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Dnal1Q05A62 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Dnal1Q05A62 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Dnal1Q05A62 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Dnal1Q05A62 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Dnal1Q05A62 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Dnal1Q05A62 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Dnal1Q05A62 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Dnal1Q05A62 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Dnal1Q05A62 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Dnal1Q05A62 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Dnal1Q05A62 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Dnal1Q05A62 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Dnal1Q05A62 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Dnal1Q05A62 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Dnal1Q05A62 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Dnal1Q05A62 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Dnal1Q05A62 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Dnal1Q05A62 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Dnal1Q05A62 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Dnal1Q05A62 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Dnal1Q05A62 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Dnal1Q05A62 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Dnal1Q05A62 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Dnal1Q05A62 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Dnal1Q05A62 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Dnal1Q05A62 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Dnal1Q05A62 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Dnal1Q05A62 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Dnal1Q05A62 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Dnal1Q05A62 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Dnal1Q05A62 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Dnal1Q05A62 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Dnal1Q05A62 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Dnal1Q05A62 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Dnal1Q05A62 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Dnal1Q05A62 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Dnal1Q05A62 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Dnal1Q05A62 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Dnal1Q05A62 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Dnal1Q05A62 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Dnal1Q05A62 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Dnal1Q05A62 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Dnal1Q05A62 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Dnal1Q05A62 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Dnal1Q05A62 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Dnal1Q05A62 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Dnal1Q05A62 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Dnal1Q05A62 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Dnal1Q05A62 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Dnal1Q05A62 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Dnal1Q05A62 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Dnal1Q05A62 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Dnal1Q05A62 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Dnal1Q05A62 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Dnal1Q05A62 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Dnal1Q05A62 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Dnal1Q05A62 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Dnal1Q05A62 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Dnal1Q05A62 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Dnal1Q05A62 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Dnal1Q05A62 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Dnal1Q05A62 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Dnal1Q05A62 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Dnal1Q05A62 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Dnal1Q05A62 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Dnal1Q05A62 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Dnal1Q05A62 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Dnal1Q05A62 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Dnal1Q05A62 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Dnal1Q05A62 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Dnal1Q05A62 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Dnal1Q05A62 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Dnal1Q05A62 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Dnal1Q05A62 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Dnal1Q05A62 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Dnal1Q05A62 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Dnal1Q05A62 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Dnal1Q05A62 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Dnal1Q05A62 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Dnal1Q05A62 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Dnal1Q05A62 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Dnal1Q05A62 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Dnal1Q05A62 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Dnal1Q05A62 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Dnal1Q05A62 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Dnal1Q05A62 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Dnal1Q05A62 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Dnal1Q05A62 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms