Protein–RNA interactions for Protein: Q05793

Hspg2, Basement membrane-specific heparan sulfate proteoglycan core protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 3,707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hspg2Q05793 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hspg2Q05793 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hspg2Q05793 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hspg2Q05793 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hspg2Q05793 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hspg2Q05793 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Hspg2Q05793 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Hspg2Q05793 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Hspg2Q05793 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hspg2Q05793 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hspg2Q05793 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hspg2Q05793 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hspg2Q05793 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hspg2Q05793 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hspg2Q05793 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hspg2Q05793 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hspg2Q05793 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hspg2Q05793 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hspg2Q05793 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Hspg2Q05793 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hspg2Q05793 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hspg2Q05793 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hspg2Q05793 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hspg2Q05793 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hspg2Q05793 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hspg2Q05793 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hspg2Q05793 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hspg2Q05793 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hspg2Q05793 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hspg2Q05793 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Hspg2Q05793 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hspg2Q05793 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hspg2Q05793 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hspg2Q05793 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hspg2Q05793 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hspg2Q05793 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hspg2Q05793 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Hspg2Q05793 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hspg2Q05793 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hspg2Q05793 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hspg2Q05793 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hspg2Q05793 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hspg2Q05793 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hspg2Q05793 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hspg2Q05793 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hspg2Q05793 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hspg2Q05793 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hspg2Q05793 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hspg2Q05793 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Hspg2Q05793 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Hspg2Q05793 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Hspg2Q05793 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hspg2Q05793 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hspg2Q05793 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hspg2Q05793 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hspg2Q05793 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hspg2Q05793 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hspg2Q05793 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hspg2Q05793 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hspg2Q05793 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hspg2Q05793 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hspg2Q05793 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hspg2Q05793 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hspg2Q05793 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hspg2Q05793 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hspg2Q05793 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hspg2Q05793 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hspg2Q05793 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hspg2Q05793 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hspg2Q05793 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hspg2Q05793 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hspg2Q05793 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hspg2Q05793 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hspg2Q05793 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hspg2Q05793 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hspg2Q05793 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hspg2Q05793 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hspg2Q05793 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hspg2Q05793 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hspg2Q05793 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hspg2Q05793 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Hspg2Q05793 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hspg2Q05793 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Hspg2Q05793 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hspg2Q05793 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hspg2Q05793 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hspg2Q05793 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hspg2Q05793 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hspg2Q05793 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hspg2Q05793 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hspg2Q05793 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hspg2Q05793 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hspg2Q05793 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hspg2Q05793 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hspg2Q05793 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hspg2Q05793 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Hspg2Q05793 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hspg2Q05793 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hspg2Q05793 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Hspg2Q05793 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms