Protein–RNA interactions for Protein: Q04690

Nf1, Neurofibromin, mousemouse

Predictions only

Length 2,841 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nf1Q04690 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nf1Q04690 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nf1Q04690 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nf1Q04690 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nf1Q04690 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nf1Q04690 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nf1Q04690 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Nf1Q04690 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nf1Q04690 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nf1Q04690 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Nf1Q04690 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nf1Q04690 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nf1Q04690 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nf1Q04690 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nf1Q04690 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nf1Q04690 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Nf1Q04690 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nf1Q04690 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nf1Q04690 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nf1Q04690 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nf1Q04690 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nf1Q04690 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nf1Q04690 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nf1Q04690 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Nf1Q04690 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nf1Q04690 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nf1Q04690 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Nf1Q04690 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nf1Q04690 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nf1Q04690 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nf1Q04690 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nf1Q04690 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nf1Q04690 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nf1Q04690 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nf1Q04690 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Nf1Q04690 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nf1Q04690 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nf1Q04690 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nf1Q04690 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Nf1Q04690 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nf1Q04690 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nf1Q04690 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nf1Q04690 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nf1Q04690 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nf1Q04690 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nf1Q04690 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nf1Q04690 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nf1Q04690 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nf1Q04690 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nf1Q04690 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nf1Q04690 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nf1Q04690 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nf1Q04690 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Nf1Q04690 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nf1Q04690 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nf1Q04690 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nf1Q04690 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nf1Q04690 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nf1Q04690 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nf1Q04690 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nf1Q04690 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Nf1Q04690 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nf1Q04690 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nf1Q04690 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nf1Q04690 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nf1Q04690 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Nf1Q04690 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nf1Q04690 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Nf1Q04690 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Nf1Q04690 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nf1Q04690 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nf1Q04690 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nf1Q04690 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nf1Q04690 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nf1Q04690 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nf1Q04690 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nf1Q04690 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nf1Q04690 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nf1Q04690 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nf1Q04690 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nf1Q04690 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nf1Q04690 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nf1Q04690 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nf1Q04690 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nf1Q04690 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nf1Q04690 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nf1Q04690 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nf1Q04690 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Nf1Q04690 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Nf1Q04690 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nf1Q04690 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Nf1Q04690 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nf1Q04690 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nf1Q04690 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nf1Q04690 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nf1Q04690 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nf1Q04690 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nf1Q04690 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Nf1Q04690 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nf1Q04690 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms