Protein–RNA interactions for Protein: Q02789

Cacna1s, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, mousemouse

Predictions only

Length 1,880 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1sQ02789 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Cacna1sQ02789 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Cacna1sQ02789 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Cacna1sQ02789 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Cacna1sQ02789 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Cacna1sQ02789 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Cacna1sQ02789 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Cacna1sQ02789 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Cacna1sQ02789 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Cacna1sQ02789 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Cacna1sQ02789 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Cacna1sQ02789 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Cacna1sQ02789 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Cacna1sQ02789 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Cacna1sQ02789 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Cacna1sQ02789 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Cacna1sQ02789 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Cacna1sQ02789 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Cacna1sQ02789 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
Cacna1sQ02789 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Cacna1sQ02789 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Cacna1sQ02789 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Cacna1sQ02789 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Cacna1sQ02789 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Cacna1sQ02789 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Cacna1sQ02789 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Cacna1sQ02789 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Cacna1sQ02789 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Cacna1sQ02789 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Cacna1sQ02789 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Cacna1sQ02789 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Cacna1sQ02789 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Cacna1sQ02789 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Cacna1sQ02789 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Cacna1sQ02789 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Cacna1sQ02789 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Cacna1sQ02789 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Cacna1sQ02789 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Cacna1sQ02789 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Cacna1sQ02789 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Cacna1sQ02789 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Cacna1sQ02789 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Cacna1sQ02789 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Cacna1sQ02789 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Cacna1sQ02789 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
Cacna1sQ02789 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
Cacna1sQ02789 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Cacna1sQ02789 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Cacna1sQ02789 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Cacna1sQ02789 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Cacna1sQ02789 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
Cacna1sQ02789 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Cacna1sQ02789 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Cacna1sQ02789 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
Cacna1sQ02789 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC26.76■■□□□ 1.88
Cacna1sQ02789 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.88
Cacna1sQ02789 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
Cacna1sQ02789 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
Cacna1sQ02789 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.88
Cacna1sQ02789 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Cacna1sQ02789 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Cacna1sQ02789 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Cacna1sQ02789 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Cacna1sQ02789 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Cacna1sQ02789 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Cacna1sQ02789 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Cacna1sQ02789 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
Cacna1sQ02789 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
Cacna1sQ02789 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Cacna1sQ02789 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Cacna1sQ02789 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Cacna1sQ02789 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Cacna1sQ02789 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Cacna1sQ02789 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Cacna1sQ02789 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Cacna1sQ02789 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Cacna1sQ02789 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Cacna1sQ02789 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Cacna1sQ02789 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Cacna1sQ02789 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Cacna1sQ02789 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Cacna1sQ02789 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Cacna1sQ02789 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Cacna1sQ02789 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Cacna1sQ02789 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Cacna1sQ02789 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Cacna1sQ02789 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Cacna1sQ02789 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Cacna1sQ02789 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Cacna1sQ02789 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Cacna1sQ02789 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Cacna1sQ02789 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Cacna1sQ02789 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Cacna1sQ02789 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Cacna1sQ02789 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Cacna1sQ02789 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Cacna1sQ02789 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Cacna1sQ02789 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Cacna1sQ02789 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Cacna1sQ02789 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms